208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3942 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  98.07 
 
 		 362 aa  701    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 362 aa  710    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 362 aa  710    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  84.25 
 
 		 363 aa  560  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  75.97 
 
 		 362 aa  559  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  74.59 
 
 		 362 aa  556  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  50.55 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2222  permease YjgP/YjgQ family protein  49.86 
 
 		 361 aa  348  9e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.225398 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  48.9 
 
 		 364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  47.38 
 
 		 365 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  46.28 
 
 		 365 aa  332  6e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2312  permease YjgP/YjgQ  46.7 
 
 		 362 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  44.9 
 
 		 365 aa  326  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  46.94 
 
 		 361 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  47.38 
 
 		 362 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  46.15 
 
 		 361 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  41.71 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  41.48 
 
 		 363 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  41.99 
 
 		 362 aa  259  4e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  39.78 
 
 		 362 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  38.5 
 
 		 360 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1758  permease YjgP/YjgQ  39.61 
 
 		 359 aa  235  7e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111369  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  36.77 
 
 		 362 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  36.36 
 
 		 362 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  36.09 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0507  YjgP/YjgQ permease  31.96 
 
 		 363 aa  206  6e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  34.86 
 
 		 369 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  36.96 
 
 		 364 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  35.33 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  35.33 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3075  permease YjgP/YjgQ  32.89 
 
 		 366 aa  182  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20702  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1813  permease YjgP/YjgQ  35.36 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578456  normal  0.607435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2529  permease YjgP/YjgQ family protein  34.72 
 
 		 367 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1189  permease YjgP/YjgQ family protein  34.79 
 
 		 365 aa  173  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216183  normal  0.433432 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2627  permease YjgP/YjgQ family protein  35.12 
 
 		 376 aa  169  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0948  permease YjgP/YjgQ  31.88 
 
 		 368 aa  145  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.046524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0901  permease YjgP/YjgQ family protein  33.33 
 
 		 373 aa  145  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1225  permease YjgP/YjgQ family protein  33.78 
 
 		 365 aa  145  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0443365  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  27.72 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  29.77 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  27.01 
 
 		 356 aa  98.6  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  24.37 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  25.84 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  24.23 
 
 		 358 aa  94  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  27.79 
 
 		 366 aa  90.5  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  27.5 
 
 		 360 aa  89.7  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  25.08 
 
 		 369 aa  89.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  25.08 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  28.81 
 
 		 350 aa  85.9  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  26.6 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3537  permease YjgP/YjgQ family protein  24.7 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  26.37 
 
 		 355 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  26.67 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  27.09 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  23.26 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  25.89 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  25.3 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44340  permease YjgP/YjgQ family  27.19 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127644  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  26.16 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  27.75 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  24.55 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  26.51 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  28.34 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  24.8 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  25.55 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  26.83 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  25.47 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  25.46 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  24.18 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  25.87 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  24.33 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  23.76 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  29.17 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  26.62 
 
 		 351 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  26.01 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02662  putative permease, YjgP/YjgQ family  26.79 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2114  permease YjgP/YjgQ  26.67 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  24.68 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  27.32 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  27.03 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  26.23 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  24.25 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4195  permease YjgP/YjgQ family protein  28.07 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3264  YjgP/YjgQ permease  26.7 
 
 		 359 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  23.46 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0926  permease YjgP/YjgQ family protein  24.5 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  24.44 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3446  YjgP/YjgQ permease  27.15 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  27.51 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3159  YjgP/YjgQ permease  27.15 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  26.98 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  27.48 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02855  conserved hypothetical protein  26.82 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000166888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02804  hypothetical protein  26.82 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000115691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0714  permease YjgP/YjgQ family protein  26.82 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3555  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  25.66 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.085708 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  26.4 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  27.5 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  23.48 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>