206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5099 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  88.4 
 
 		 362 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 362 aa  707    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  76.52 
 
 		 363 aa  523  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  75.97 
 
 		 362 aa  521  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  75.97 
 
 		 362 aa  521  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  75.97 
 
 		 362 aa  520  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  51.64 
 
 		 362 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2222  permease YjgP/YjgQ family protein  50.41 
 
 		 361 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.225398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  45.45 
 
 		 365 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  46.28 
 
 		 365 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  48.08 
 
 		 364 aa  325  6e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  45.18 
 
 		 365 aa  324  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  47.25 
 
 		 362 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2312  permease YjgP/YjgQ  45.73 
 
 		 362 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  45.96 
 
 		 361 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  44.9 
 
 		 361 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  39.84 
 
 		 363 aa  245  6.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  38.12 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  38.4 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  39.01 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  36.78 
 
 		 362 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1758  permease YjgP/YjgQ  38.78 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111369  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  37.12 
 
 		 362 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0507  YjgP/YjgQ permease  31.4 
 
 		 363 aa  209  9e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  36.86 
 
 		 364 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  35.26 
 
 		 362 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  34.71 
 
 		 362 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  36.31 
 
 		 364 aa  195  9e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  35.75 
 
 		 369 aa  195  9e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  36.31 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2529  permease YjgP/YjgQ family protein  34.99 
 
 		 367 aa  179  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3075  permease YjgP/YjgQ  33.16 
 
 		 366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20702  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1813  permease YjgP/YjgQ  34.59 
 
 		 364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578456  normal  0.607435 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2627  permease YjgP/YjgQ family protein  35.86 
 
 		 376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1189  permease YjgP/YjgQ family protein  33.06 
 
 		 365 aa  159  7e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216183  normal  0.433432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1225  permease YjgP/YjgQ family protein  32.88 
 
 		 365 aa  135  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0443365  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0948  permease YjgP/YjgQ  30.89 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.046524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0901  permease YjgP/YjgQ family protein  32.18 
 
 		 373 aa  130  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  27.64 
 
 		 371 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  27.41 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  25.07 
 
 		 359 aa  99.4  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  28.69 
 
 		 366 aa  96.3  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3537  permease YjgP/YjgQ family protein  24.56 
 
 		 369 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234236 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  26.3 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  24.29 
 
 		 358 aa  86.3  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  25.43 
 
 		 352 aa  86.3  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3264  YjgP/YjgQ permease  27.71 
 
 		 359 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3446  YjgP/YjgQ permease  27.67 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02855  conserved hypothetical protein  27.38 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000166888  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0714  permease YjgP/YjgQ family protein  27.38 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02804  hypothetical protein  27.38 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000115691  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3159  YjgP/YjgQ permease  28 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  24.62 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  27.56 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  24.62 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  26.42 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  24.07 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  26.36 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  28.57 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  25.5 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  27.11 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  25.2 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  25.37 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  27.52 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  23.03 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  26.15 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  25.65 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0926  permease YjgP/YjgQ family protein  23.74 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  25.36 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  24.78 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  24.04 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1374  SecD export membrane protein  25.35 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  24.79 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  23.56 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  25.66 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  26.15 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44340  permease YjgP/YjgQ family  27.16 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  25.97 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  22.38 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  24.14 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  25.07 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  24.58 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  24.85 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  23.66 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  25.98 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  23.84 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  25.74 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  28.32 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3555  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  24.46 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  24.63 
 
 		 353 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  24.51 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>