205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2602 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  91.16 
 
 
362 aa  655    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 
362 aa  734    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  90.88 
 
 
362 aa  656    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0507  YjgP/YjgQ permease  60.61 
 
 
363 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  53.59 
 
 
360 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1758  permease YjgP/YjgQ  52.49 
 
 
359 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111369  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  49.44 
 
 
362 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  48.6 
 
 
362 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  48.88 
 
 
362 aa  351  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  37.29 
 
 
362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  36.78 
 
 
362 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  38.46 
 
 
364 aa  239  6.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  37.98 
 
 
365 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2222  permease YjgP/YjgQ family protein  37.29 
 
 
361 aa  237  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.225398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  39.78 
 
 
362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  39.78 
 
 
362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  39.5 
 
 
362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  36.34 
 
 
365 aa  230  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  36.07 
 
 
365 aa  229  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  34.52 
 
 
361 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  35.07 
 
 
361 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2312  permease YjgP/YjgQ  34.52 
 
 
362 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  34.25 
 
 
362 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  34.25 
 
 
362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  38.12 
 
 
363 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  36.07 
 
 
363 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  31.32 
 
 
364 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  30.3 
 
 
364 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  30.03 
 
 
364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  30.52 
 
 
369 aa  164  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2627  permease YjgP/YjgQ family protein  31.09 
 
 
376 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1813  permease YjgP/YjgQ  28.53 
 
 
364 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578456  normal  0.607435 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1189  permease YjgP/YjgQ family protein  30.77 
 
 
365 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216183  normal  0.433432 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3075  permease YjgP/YjgQ  29.2 
 
 
366 aa  152  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20702  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2529  permease YjgP/YjgQ family protein  27.86 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337345  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0901  permease YjgP/YjgQ family protein  29.49 
 
 
373 aa  123  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0948  permease YjgP/YjgQ  26.1 
 
 
368 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.046524  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1225  permease YjgP/YjgQ family protein  30.08 
 
 
365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0443365  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  26.15 
 
 
371 aa  99.4  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  24.45 
 
 
364 aa  94  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  24.18 
 
 
362 aa  91.3  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  25.69 
 
 
359 aa  89.7  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  23.71 
 
 
366 aa  87  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  24.79 
 
 
359 aa  86.7  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  25.27 
 
 
358 aa  86.3  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  23 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  23.53 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  23.53 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  21.41 
 
 
369 aa  76.3  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  22.15 
 
 
359 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  24.42 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  23.89 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  26.51 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  24.19 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  23.03 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  24.19 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  23.67 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  22.34 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  22.69 
 
 
353 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  23.62 
 
 
354 aa  72  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4195  permease YjgP/YjgQ family protein  23.6 
 
 
358 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  23.86 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  22.54 
 
 
356 aa  71.6  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  22.9 
 
 
356 aa  71.6  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  19.2 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  19.68 
 
 
369 aa  69.3  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  23.95 
 
 
353 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  25.5 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  22.08 
 
 
369 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11680  permease YjgP/YjgQ family  25.79 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623053  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  23.43 
 
 
357 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  19.68 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  24.25 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  22.06 
 
 
359 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  25.43 
 
 
360 aa  67  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  21.71 
 
 
355 aa  66.2  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02662  putative permease, YjgP/YjgQ family  23.34 
 
 
368 aa  65.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  21.14 
 
 
355 aa  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2199  YjgP/YjgQ family protein  22.86 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  23.72 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1855  permease YjgP/YjgQ family protein  22.86 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  21.37 
 
 
356 aa  63.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  21.47 
 
 
355 aa  63.5  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  21.64 
 
 
353 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  23.48 
 
 
354 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  22.68 
 
 
356 aa  63.5  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  22.57 
 
 
360 aa  63.5  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 
1040 aa  63.2  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  22.65 
 
 
383 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0582  hypothetical protein  24.35 
 
 
356 aa  62.4  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.878195  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  22.38 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  23.14 
 
 
359 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  22.54 
 
 
360 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  20.96 
 
 
352 aa  61.6  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  21.97 
 
 
360 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  22.54 
 
 
356 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3446  YjgP/YjgQ permease  23.79 
 
 
359 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  24.52 
 
 
359 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 
352 aa  60.8  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>