275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2177 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  100 
 
 		 366 aa  728    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  59.89 
 
 		 364 aa  424  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  55.46 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  27.91 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  26.57 
 
 		 358 aa  119  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  27.49 
 
 		 371 aa  115  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  24.22 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  26.9 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  28.69 
 
 		 362 aa  106  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  30.3 
 
 		 359 aa  106  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  29.38 
 
 		 362 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  27.01 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1678  permease YjgP/YjgQ family protein  29.48 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.936868  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  26.6 
 
 		 362 aa  96.7  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  24.4 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  25.38 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  24.26 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  24.19 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  24.53 
 
 		 362 aa  91.3  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  24.18 
 
 		 353 aa  91.3  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  27.33 
 
 		 352 aa  90.5  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  23.75 
 
 		 356 aa  89.7  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  27.76 
 
 		 362 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  25.07 
 
 		 355 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 352 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  27.76 
 
 		 362 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  27.76 
 
 		 362 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 352 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 352 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  23.3 
 
 		 356 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  25.28 
 
 		 352 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  25.28 
 
 		 352 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  25.28 
 
 		 352 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  25.47 
 
 		 360 aa  87.4  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  25.28 
 
 		 352 aa  87  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  22.83 
 
 		 356 aa  87  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  25.49 
 
 		 352 aa  86.7  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  25.24 
 
 		 369 aa  87  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  26.67 
 
 		 387 aa  86.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  23.1 
 
 		 359 aa  86.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2681  permease YjgP/YjgQ family protein  24.66 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  24.83 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  24.72 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  25.24 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  26.3 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  25.41 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2221  permease YjgP/YjgQ family protein  24.39 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.481086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  28.61 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  26.38 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  28.3 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  23.16 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  26.01 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  21 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3555  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  26.29 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  26.21 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  26.4 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  22.97 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  24.44 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4735  inner membrane protein YjgQ  25.55 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0130058  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4865  inner membrane protein YjgQ  25.55 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000705517  normal  0.203916 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4828  inner membrane protein YjgQ  25.55 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4765  inner membrane protein YjgQ  25.55 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000537326  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2529  permease YjgP/YjgQ family protein  28.88 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0926  permease YjgP/YjgQ family protein  24.17 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  25.14 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  25.14 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4884  hypothetical protein  25.55 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2417  hypothetical protein  23.98 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  24.53 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2171  permease YjgP/YjgQ family protein  25.24 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.103114 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1758  permease YjgP/YjgQ  25.61 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111369  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3066  permease YjgP/YjgQ family protein  23.63 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.326563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4818  putative permease  25.68 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  25.07 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  23.03 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  24.52 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  23.64 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04128  conserved inner membrane protein  25.41 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00895829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  25.41 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00436584  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  23.61 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  23.65 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  22.85 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5784  putative permease  25.41 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000901519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  23.08 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4518  putative permease  25.41 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136034  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  25.33 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4743  putative permease  25.41 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000687106  normal  0.744445 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4835  putative permease  25.41 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000478457  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3750  permease YjgP/YjgQ family protein  25.41 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000963246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04092  hypothetical protein  25.41 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2222  permease YjgP/YjgQ family protein  23.45 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.225398 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  22.26 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3646  permease YjgP/YjgQ family protein  24.73 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000255423  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  23.62 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  23.46 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>