238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2685 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  100 
 
 		 383 aa  772    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  86.08 
 
 		 387 aa  677    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2417  hypothetical protein  71.14 
 
 		 401 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2221  permease YjgP/YjgQ family protein  71.25 
 
 		 397 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.481086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2681  permease YjgP/YjgQ family protein  70.63 
 
 		 397 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  56.28 
 
 		 382 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3640  membrane protein, YjgP/YjgQ like  56.02 
 
 		 382 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0821  hypothetical protein  57.44 
 
 		 383 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0670  hypothetical protein  57.44 
 
 		 383 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144259  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0826  permease YjgP/YjgQ family protein  57.07 
 
 		 382 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.792817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1173  hypothetical protein  57.44 
 
 		 383 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.200928  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5799  YjgP/YjgQ like transporter  57.33 
 
 		 382 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2385  permease YjgP/YjgQ family protein  56.81 
 
 		 382 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1655  hypothetical protein  57.44 
 
 		 383 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1857  permease YjgP/YjgQ  57.07 
 
 		 382 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.693669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1020  hypothetical protein  57.44 
 
 		 383 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1013  hypothetical protein  57.44 
 
 		 383 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17557  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2517  permease YjgP/YjgQ family protein  56.81 
 
 		 382 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2227  permease YjgP/YjgQ family protein  57.07 
 
 		 382 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2341  hypothetical protein  57.44 
 
 		 383 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2944  hypothetical protein  57.44 
 
 		 383 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2468  permease YjgP/YjgQ family protein  56.81 
 
 		 382 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2473  permease YjgP/YjgQ family protein  56.81 
 
 		 382 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0621  permease YjgP/YjgQ family protein  53.61 
 
 		 384 aa  404  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185223  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1235  permease YjgP/YjgQ family protein  54.33 
 
 		 386 aa  402  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.104582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  39.43 
 
 		 356 aa  301  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  41.33 
 
 		 358 aa  280  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  40 
 
 		 373 aa  280  4e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.085708 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0582  hypothetical protein  41.05 
 
 		 356 aa  253  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.878195  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  38.85 
 
 		 362 aa  246  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  39.09 
 
 		 369 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  37.08 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  37.08 
 
 		 369 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2114  permease YjgP/YjgQ  40 
 
 		 368 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  37.58 
 
 		 381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  36.96 
 
 		 365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2597  permease YjgP/YjgQ family protein  38.9 
 
 		 368 aa  232  7.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  39.22 
 
 		 369 aa  232  8.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2171  permease YjgP/YjgQ family protein  37.04 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.103114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3537  permease YjgP/YjgQ family protein  36.39 
 
 		 369 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234236 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  29.79 
 
 		 354 aa  186  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2138  permease YjgP/YjgQ  30.95 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  29.11 
 
 		 353 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  30.75 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0963  permease YjgP/YjgQ family protein  30.17 
 
 		 353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  28.3 
 
 		 355 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  32.52 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  28.57 
 
 		 353 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0926  permease YjgP/YjgQ family protein  31.56 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  27.76 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  27.78 
 
 		 358 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  28.12 
 
 		 356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  30.98 
 
 		 352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  31.48 
 
 		 352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  31.48 
 
 		 352 aa  173  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  31.52 
 
 		 352 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4884  hypothetical protein  29.02 
 
 		 360 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  28.38 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4735  inner membrane protein YjgQ  29.02 
 
 		 360 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0130058  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  28.76 
 
 		 353 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4865  inner membrane protein YjgQ  29.02 
 
 		 360 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000705517  normal  0.203916 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4828  inner membrane protein YjgQ  29.02 
 
 		 360 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4765  inner membrane protein YjgQ  29.02 
 
 		 360 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000537326  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  30.71 
 
 		 352 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3646  permease YjgP/YjgQ family protein  27.97 
 
 		 360 aa  171  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000255423  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 		 354 aa  170  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4818  putative permease  28.23 
 
 		 360 aa  170  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339649  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  29.6 
 
 		 351 aa  169  7e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  27.66 
 
 		 356 aa  169  7e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04128  conserved inner membrane protein  28.23 
 
 		 360 aa  169  9e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00895829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  28.23 
 
 		 360 aa  169  9e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00436584  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3750  permease YjgP/YjgQ family protein  28.23 
 
 		 360 aa  169  9e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000963246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04092  hypothetical protein  28.23 
 
 		 360 aa  169  9e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4835  putative permease  28.23 
 
 		 360 aa  169  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000478457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4518  putative permease  28.23 
 
 		 360 aa  169  9e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136034  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4743  putative permease  28.23 
 
 		 360 aa  169  9e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000687106  normal  0.744445 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5784  putative permease  28.23 
 
 		 360 aa  169  9e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000901519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  28.57 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  28.3 
 
 		 353 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  31.35 
 
 		 352 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  31.35 
 
 		 352 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  31.35 
 
 		 352 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  31.35 
 
 		 352 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  29.26 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  28.72 
 
 		 356 aa  166  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  28.72 
 
 		 358 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  28.72 
 
 		 358 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  28.72 
 
 		 358 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  26.79 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  28.3 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  28.03 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  31.66 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  30.54 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  28.03 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  28.9 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0390  permease YjgP/YjgQ family protein  27.81 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  29.84 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  27.49 
 
 		 355 aa  164  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  26.53 
 
 		 356 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  28.57 
 
 		 356 aa  162  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>