259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2464 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  100 
 
 		 360 aa  706    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  96.39 
 
 		 360 aa  670    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  96.94 
 
 		 360 aa  674    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4195  permease YjgP/YjgQ family protein  69.72 
 
 		 358 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1403  permease YjgP/YjgQ family protein  72.98 
 
 		 360 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  27.76 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  25.71 
 
 		 359 aa  119  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  25.5 
 
 		 792 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  24.16 
 
 		 362 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  26.4 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  26.98 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  25.62 
 
 		 360 aa  94  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  24.52 
 
 		 359 aa  92.8  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  27.42 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 360 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  23.89 
 
 		 354 aa  90.1  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  28.31 
 
 		 356 aa  90.1  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  23.72 
 
 		 360 aa  89.4  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  25.35 
 
 		 358 aa  86.7  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  22.25 
 
 		 358 aa  86.3  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  21.21 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  21.29 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  23.16 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  26.07 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  25.47 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  19.89 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  25.08 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  26.2 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.085708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  22.04 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  22.31 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  21.58 
 
 		 387 aa  79.3  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  22.04 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3537  permease YjgP/YjgQ family protein  24.76 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234236 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  20.74 
 
 		 1040 aa  77  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  23.62 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  22.62 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  21.39 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  24.07 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  21.09 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2171  permease YjgP/YjgQ family protein  22.04 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.103114 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  25.74 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  23.38 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  25.63 
 
 		 364 aa  72  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2114  permease YjgP/YjgQ  22.62 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  23.24 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  22.28 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  20.57 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2138  permease YjgP/YjgQ  24.3 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  22.53 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  26.95 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  27.17 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  27.17 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  22.44 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4009  permease YjgP/YjgQ family protein  22.29 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.604815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  26.43 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  18.89 
 
 		 353 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02662  putative permease, YjgP/YjgQ family  24.93 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  21.8 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  27.37 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0821  hypothetical protein  23.96 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  20.22 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  21.53 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1013  hypothetical protein  24.48 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17557  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1857  permease YjgP/YjgQ  23.32 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.693669  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2385  permease YjgP/YjgQ family protein  23.39 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2517  permease YjgP/YjgQ family protein  23.39 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2473  permease YjgP/YjgQ family protein  23.32 
 
 		 382 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0670  hypothetical protein  24.74 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144259  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1173  hypothetical protein  24.74 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.200928  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0826  permease YjgP/YjgQ family protein  23.32 
 
 		 382 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.792817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2468  permease YjgP/YjgQ family protein  23.32 
 
 		 382 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1020  hypothetical protein  24.74 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1655  hypothetical protein  24.74 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2341  hypothetical protein  24.74 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2944  hypothetical protein  24.74 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  23.3 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5799  YjgP/YjgQ like transporter  23.06 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  26.97 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2627  permease YjgP/YjgQ family protein  27.3 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0538  permease YjgP/YjgQ family protein  26.02 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0426669  normal  0.993388 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  21.18 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  28.09 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  23.3 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  21.97 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2597  permease YjgP/YjgQ family protein  23.73 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  20.78 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3640  membrane protein, YjgP/YjgQ like  24.61 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  24.61 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0375  permease YjgP/YjgQ family protein  27.25 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0887769 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  19.44 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2312  permease YjgP/YjgQ  22.46 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  24.02 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  20.85 
 
 		 1153 aa  63.5  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0100  permease YjgP/YjgQ family protein  24.13 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  22.54 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2221  permease YjgP/YjgQ family protein  20.52 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.481086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2681  permease YjgP/YjgQ family protein  20.93 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  23.48 
 
 		 361 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>