183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1225 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1225  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 365 aa  706    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0443365  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2529  permease YjgP/YjgQ family protein  36.81 
 
 		 367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  32.33 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  32.01 
 
 		 364 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  32.88 
 
 		 362 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  31.49 
 
 		 363 aa  173  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  32.17 
 
 		 362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  32.15 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  33.78 
 
 		 362 aa  170  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3075  permease YjgP/YjgQ  33.33 
 
 		 366 aa  170  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20702  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2312  permease YjgP/YjgQ  28.92 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  33.78 
 
 		 362 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  33.78 
 
 		 362 aa  168  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  30.54 
 
 		 362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1758  permease YjgP/YjgQ  29.32 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111369  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  31.28 
 
 		 362 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  28.61 
 
 		 365 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  29.65 
 
 		 365 aa  162  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  29.08 
 
 		 365 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  29.97 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2222  permease YjgP/YjgQ family protein  29.51 
 
 		 361 aa  158  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.225398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  29.65 
 
 		 362 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0507  YjgP/YjgQ permease  29.89 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  29.95 
 
 		 362 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  31.71 
 
 		 362 aa  157  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  31.71 
 
 		 362 aa  156  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  27.49 
 
 		 361 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  32.61 
 
 		 369 aa  153  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  30.08 
 
 		 362 aa  152  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  27.76 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  29.7 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  29.7 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  29.97 
 
 		 363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0948  permease YjgP/YjgQ  31.96 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.046524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2627  permease YjgP/YjgQ family protein  31.03 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1189  permease YjgP/YjgQ family protein  30.08 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216183  normal  0.433432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1813  permease YjgP/YjgQ  28.3 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578456  normal  0.607435 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0901  permease YjgP/YjgQ family protein  30.08 
 
 		 373 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  27.25 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  25.68 
 
 		 358 aa  97.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  26.33 
 
 		 359 aa  93.6  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  27.86 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  27.2 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  25.93 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  30.19 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  24.58 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4009  permease YjgP/YjgQ family protein  26.59 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.604815 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  24.39 
 
 		 365 aa  69.3  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  23.56 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3537  permease YjgP/YjgQ family protein  23.68 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234236 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  23.27 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  22.99 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  25.78 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  26.46 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  25.29 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  22.79 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  25.69 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2199  YjgP/YjgQ family protein  24.78 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1855  permease YjgP/YjgQ family protein  24.78 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  23.8 
 
 		 360 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  24.65 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  23.92 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  26.63 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  24.58 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  23.65 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  28.37 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2114  permease YjgP/YjgQ  26.07 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  25.6 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  24.84 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  25.64 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  22.68 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  21.49 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  26.49 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  22.25 
 
 		 401 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  24.79 
 
 		 359 aa  56.2  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  23.3 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1374  SecD export membrane protein  29.75 
 
 		 352 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  24.66 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  26.65 
 
 		 356 aa  54.3  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  24.83 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0926  permease YjgP/YjgQ family protein  23.48 
 
 		 352 aa  54.3  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  22.64 
 
 		 1040 aa  53.9  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 792 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  25.23 
 
 		 356 aa  53.9  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  24.93 
 
 		 353 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  26.52 
 
 		 360 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  30.17 
 
 		 356 aa  53.1  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  23.58 
 
 		 358 aa  52.8  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  31.18 
 
 		 353 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  22.4 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2171  permease YjgP/YjgQ family protein  22.15 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.103114 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0976  putative permease, YjgP/YjgQ family  27.54 
 
 		 341 aa  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  25.34 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  23.21 
 
 		 381 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  27.62 
 
 		 360 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  25 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>