263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1837 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 
434 aa  896    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  61.83 
 
 
395 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  62.09 
 
 
395 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  47.3 
 
 
391 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  46.49 
 
 
391 aa  369  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  45.65 
 
 
388 aa  355  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  42.9 
 
 
392 aa  345  1e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  45.56 
 
 
393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  45.56 
 
 
393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  38.81 
 
 
394 aa  306  5.0000000000000004e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  38.07 
 
 
374 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  34.86 
 
 
389 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  33.51 
 
 
401 aa  239  9e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  32.89 
 
 
400 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  32.89 
 
 
401 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  32.7 
 
 
401 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  32.88 
 
 
384 aa  226  4e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  32.43 
 
 
403 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  30.21 
 
 
386 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  32.88 
 
 
395 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  31.96 
 
 
395 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  33.33 
 
 
386 aa  194  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  28.73 
 
 
356 aa  155  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  24.14 
 
 
365 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  28.96 
 
 
1040 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  24.13 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  24.12 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  23.95 
 
 
358 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  25.6 
 
 
391 aa  111  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  23.54 
 
 
418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  23.68 
 
 
359 aa  110  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 
1061 aa  110  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 
1061 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  26.1 
 
 
423 aa  106  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  24.4 
 
 
364 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  22.49 
 
 
391 aa  103  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  23.21 
 
 
399 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  23.47 
 
 
360 aa  102  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  26.03 
 
 
360 aa  100  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  24.49 
 
 
792 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  23.04 
 
 
360 aa  98.6  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  25.99 
 
 
387 aa  98.6  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  20.69 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  22.67 
 
 
391 aa  97.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.84 
 
 
364 aa  98.2  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  23.68 
 
 
418 aa  95.9  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  26.85 
 
 
360 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  23.86 
 
 
359 aa  95.1  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  26.57 
 
 
359 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  24.07 
 
 
360 aa  94.4  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  22.51 
 
 
359 aa  94  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  25.13 
 
 
371 aa  94.4  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  25.3 
 
 
359 aa  92.4  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  22.77 
 
 
362 aa  92.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  22.1 
 
 
360 aa  91.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  25.41 
 
 
359 aa  90.5  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  20.05 
 
 
403 aa  90.1  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  25.25 
 
 
361 aa  89  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  20.83 
 
 
363 aa  87.4  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  22.96 
 
 
357 aa  84  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  21.37 
 
 
1111 aa  81.3  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.27 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 
1153 aa  80.9  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  21.84 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  21.14 
 
 
1096 aa  80.1  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  21.84 
 
 
358 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  23.84 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  22.51 
 
 
379 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  20.75 
 
 
362 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  22.08 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  23.75 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  24.07 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  21.18 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  24.47 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  23.94 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  21.45 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  20.05 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  22.43 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  21.35 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  28.49 
 
 
478 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  23.93 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  24 
 
 
443 aa  70.1  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 
501 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  23.51 
 
 
441 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  21.91 
 
 
442 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1296  permease YjgP/YjgQ family protein  23.32 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00381796  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  23.21 
 
 
358 aa  68.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  23 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  30.25 
 
 
480 aa  67.4  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  26.72 
 
 
498 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2209  permease YjgP/YjgQ family protein  22.54 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145759  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  21.82 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  21.41 
 
 
359 aa  67  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  23.72 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0375  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0887769 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0048  permease YjgP/YjgQ  22.68 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  24.56 
 
 
483 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  22.49 
 
 
392 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  19.14 
 
 
370 aa  66.2  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  23.64 
 
 
363 aa  65.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.465141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>