More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1638 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 382 aa  766    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  47.15 
 
 		 389 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  44.44 
 
 		 418 aa  339  5e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  55.49 
 
 		 379 aa  326  5e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  44.42 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  47.01 
 
 		 399 aa  310  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  43.12 
 
 		 391 aa  295  9e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  37.97 
 
 		 418 aa  226  7e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  33.24 
 
 		 392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  33.43 
 
 		 391 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  32.09 
 
 		 379 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  30.93 
 
 		 380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  31.68 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  29.4 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1296  permease YjgP/YjgQ family protein  32.44 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00381796  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  27.17 
 
 		 365 aa  142  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  29.02 
 
 		 792 aa  139  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  30.56 
 
 		 371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  28.14 
 
 		 392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  26.72 
 
 		 423 aa  130  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  26.74 
 
 		 356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  30.2 
 
 		 371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  30.26 
 
 		 371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  27.73 
 
 		 356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  28.07 
 
 		 394 aa  123  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  26.4 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  26.47 
 
 		 1040 aa  121  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  27.52 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  24.2 
 
 		 403 aa  116  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  26.16 
 
 		 401 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  25.92 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  23.06 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  26.13 
 
 		 384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  24.28 
 
 		 391 aa  113  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  23.76 
 
 		 395 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  23.76 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  26.17 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  25.32 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  23.39 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  24.73 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  27.42 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  26.06 
 
 		 1061 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  26.06 
 
 		 1061 aa  103  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  25.4 
 
 		 386 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  25.77 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  20.69 
 
 		 434 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  25.35 
 
 		 364 aa  98.6  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  27.09 
 
 		 360 aa  97.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 417 aa  96.7  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  30.18 
 
 		 481 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  24.52 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3905  permease YjgP/YjgQ family protein  24.29 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  26.1 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  24.84 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  25.98 
 
 		 360 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  28.57 
 
 		 386 aa  92  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  27.78 
 
 		 371 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  27.57 
 
 		 371 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  28.24 
 
 		 383 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  28.24 
 
 		 371 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  23.77 
 
 		 393 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  24.12 
 
 		 374 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  24.53 
 
 		 384 aa  89.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  23.77 
 
 		 393 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  22.9 
 
 		 396 aa  88.6  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  24.33 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  25.7 
 
 		 372 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  24.36 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  25.77 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  23.24 
 
 		 442 aa  88.6  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  24 
 
 		 442 aa  87.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  26.88 
 
 		 396 aa  87.8  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  24.76 
 
 		 363 aa  87.8  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  26.83 
 
 		 403 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  21.72 
 
 		 444 aa  86.7  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  26.18 
 
 		 373 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  22.93 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  23.93 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  27.42 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  24.75 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  24.41 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3065  permease YjgP/YjgQ family protein  27.08 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  26.85 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  26.67 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2209  permease YjgP/YjgQ family protein  26.58 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  25.36 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  28.24 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  26.41 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  23.41 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  27.12 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  24.6 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  25.74 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  24.51 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  27.89 
 
 		 501 aa  79.7  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  22.77 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  23.47 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  24.89 
 
 		 498 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  20.71 
 
 		 1096 aa  79  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  24.64 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>