201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1323 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 478 aa  976    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  44.67 
 
 		 480 aa  365  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  38.37 
 
 		 483 aa  315  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  39.03 
 
 		 501 aa  305  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  35.39 
 
 		 498 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_002950  PG0598  hypothetical protein  35.21 
 
 		 651 aa  270  2.9999999999999997e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0011  permease YjgP/YjgQ family protein  28.82 
 
 		 527 aa  241  2e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  34.13 
 
 		 481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  30.44 
 
 		 442 aa  220  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  30.13 
 
 		 495 aa  213  4.9999999999999996e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  29.05 
 
 		 442 aa  209  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06260  hypothetical protein  31.15 
 
 		 456 aa  206  6e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0371515  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2110  permease YjgP/YjgQ family protein  33.48 
 
 		 486 aa  205  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185125  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  30.86 
 
 		 444 aa  196  9e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  28.48 
 
 		 441 aa  194  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  28.88 
 
 		 441 aa  182  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  27.19 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  27.13 
 
 		 443 aa  179  7e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  21.71 
 
 		 417 aa  95.5  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  24.29 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  26.47 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  26.86 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  26.86 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  31.22 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  27.85 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  24.29 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  26.26 
 
 		 394 aa  76.3  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  23.74 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  28.43 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  25.73 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  28.49 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  25.38 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  30.37 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  23.58 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  24.55 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  22.44 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  23.17 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  28.31 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  28.31 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  23.83 
 
 		 402 aa  67  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  35.88 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  23.17 
 
 		 402 aa  66.6  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  26.58 
 
 		 391 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  32.14 
 
 		 792 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  23.21 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  30.23 
 
 		 361 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  28.31 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  25.23 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  23.62 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  24.74 
 
 		 1096 aa  64.7  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  23.45 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  27.4 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  22.58 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  24.81 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1296  permease YjgP/YjgQ family protein  29.83 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00381796  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  22.22 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1043  hypothetical protein  22.02 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0296445  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  23.98 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  26.58 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  25.11 
 
 		 372 aa  63.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  29.32 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  20.38 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  20.41 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  24.12 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  24.4 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  23.89 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  21.67 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  28.57 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  24.84 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  23.39 
 
 		 356 aa  59.3  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  24.8 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  24.28 
 
 		 382 aa  59.7  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3417  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  24.23 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  23.72 
 
 		 1153 aa  58.9  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  24.15 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  24.7 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  21.81 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3905  permease YjgP/YjgQ family protein  20.29 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  20 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  23.27 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  22.74 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  23.51 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  27.38 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  24.19 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0684  permease YjgP/YjgQ family protein  24.78 
 
 		 346 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000671821  normal  0.0817909 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.25 
 
 		 360 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  34.33 
 
 		 359 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  24.19 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  21.57 
 
 		 392 aa  55.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  30.23 
 
 		 360 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  22.5 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  23.32 
 
 		 370 aa  55.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  23.6 
 
 		 388 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1679  permease YjgP/YjgQ family protein  22.43 
 
 		 409 aa  54.7  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.164561  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  21.3 
 
 		 365 aa  54.3  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  22.01 
 
 		 364 aa  54.7  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  22.17 
 
 		 396 aa  53.5  0.000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>