More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_17490 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 
365 aa  740    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  33.8 
 
 
356 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  34.48 
 
 
391 aa  202  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  31.28 
 
 
394 aa  202  6e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  29.1 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  31.3 
 
 
388 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  30.5 
 
 
391 aa  187  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  30.77 
 
 
403 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  29.71 
 
 
401 aa  179  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  30.77 
 
 
389 aa  176  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  30.97 
 
 
395 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  29.37 
 
 
374 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  28.84 
 
 
395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  27.89 
 
 
386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  30.97 
 
 
395 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  28.84 
 
 
395 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  29.02 
 
 
401 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  33.51 
 
 
356 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  28.46 
 
 
401 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  30.08 
 
 
391 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  29.02 
 
 
384 aa  166  9e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  29.4 
 
 
393 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  29.4 
 
 
393 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  27.68 
 
 
400 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  28.73 
 
 
359 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  30.48 
 
 
391 aa  156  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  27.15 
 
 
360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  30.19 
 
 
389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  24.14 
 
 
434 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  27.98 
 
 
359 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  27.69 
 
 
358 aa  142  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  27.17 
 
 
382 aa  142  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  26.54 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  25.68 
 
 
418 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  26.27 
 
 
399 aa  139  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 
360 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  26.43 
 
 
386 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  31.13 
 
 
1040 aa  135  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  27.53 
 
 
359 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  26.05 
 
 
359 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  24.65 
 
 
370 aa  123  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  25.2 
 
 
371 aa  123  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 
403 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  27.12 
 
 
418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  25.77 
 
 
792 aa  119  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  26.16 
 
 
357 aa  119  7e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  26.37 
 
 
364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  24.59 
 
 
392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  25.41 
 
 
362 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  23.49 
 
 
444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  26.27 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  26.05 
 
 
423 aa  113  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  24.38 
 
 
359 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 
387 aa  112  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  24.87 
 
 
1061 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  25.28 
 
 
359 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  24.43 
 
 
380 aa  110  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  24.33 
 
 
1061 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  22.65 
 
 
360 aa  109  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  26.32 
 
 
361 aa  106  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  23.39 
 
 
360 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  24.46 
 
 
356 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  25.9 
 
 
1153 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  23.22 
 
 
359 aa  103  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  25.64 
 
 
378 aa  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  28.57 
 
 
379 aa  102  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 
364 aa  99.8  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 
358 aa  97.4  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  24.06 
 
 
397 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  24.52 
 
 
364 aa  96.3  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2209  permease YjgP/YjgQ family protein  25.06 
 
 
377 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145759  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  24.85 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  23.85 
 
 
1096 aa  94  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  24.05 
 
 
384 aa  90.9  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  26.3 
 
 
443 aa  90.1  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  36.81 
 
 
441 aa  89.7  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  24.6 
 
 
370 aa  89.7  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  24.8 
 
 
350 aa  89.4  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  23.63 
 
 
1111 aa  89.4  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  23.47 
 
 
358 aa  87.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3159  YjgP/YjgQ permease  25.95 
 
 
359 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3264  YjgP/YjgQ permease  25.95 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  23.61 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3446  YjgP/YjgQ permease  25.95 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02855  conserved hypothetical protein  25.95 
 
 
386 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000166888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02804  hypothetical protein  25.95 
 
 
359 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000115691  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  28.37 
 
 
442 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0714  permease YjgP/YjgQ family protein  25.95 
 
 
359 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  27.75 
 
 
442 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  22.85 
 
 
363 aa  82.4  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  23.85 
 
 
360 aa  82.4  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  22.78 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  24.6 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  22.7 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  25.28 
 
 
358 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  24.35 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1678  permease YjgP/YjgQ family protein  25.4 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.936868  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  21.37 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  21.15 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>