More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1307 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 
356 aa  709    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  33.51 
 
 
365 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  28.73 
 
 
356 aa  169  5e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  28.91 
 
 
391 aa  164  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  27.35 
 
 
391 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  27.59 
 
 
392 aa  153  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  26.27 
 
 
388 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  25.71 
 
 
1040 aa  140  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  26.42 
 
 
394 aa  140  4.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  26.93 
 
 
395 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  25.34 
 
 
364 aa  139  7e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  26.79 
 
 
395 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  29 
 
 
374 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  25.26 
 
 
792 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  26.12 
 
 
359 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  26.5 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  26.13 
 
 
401 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 
389 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  27.6 
 
 
393 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  27.6 
 
 
393 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  27.73 
 
 
382 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 
359 aa  126  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  26.72 
 
 
401 aa  126  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  24.79 
 
 
358 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  27.05 
 
 
391 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  24.87 
 
 
401 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  24.13 
 
 
434 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  26.89 
 
 
360 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  23.96 
 
 
360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  24.53 
 
 
400 aa  119  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  27.09 
 
 
360 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  24.02 
 
 
391 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  24.6 
 
 
386 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  25 
 
 
399 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  24.27 
 
 
418 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  23.58 
 
 
362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  24.58 
 
 
359 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  24.93 
 
 
384 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  25.42 
 
 
359 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  22.85 
 
 
403 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  23.55 
 
 
389 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  24.44 
 
 
357 aa  104  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  28.03 
 
 
379 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  24.33 
 
 
395 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 
1096 aa  100  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  24.33 
 
 
395 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 
356 aa  100  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  23.16 
 
 
360 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 
1153 aa  99.8  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  21.39 
 
 
386 aa  98.6  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  24.72 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  25.28 
 
 
1111 aa  97.8  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  26.1 
 
 
423 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  25.82 
 
 
364 aa  98.6  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  23.23 
 
 
360 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  24.65 
 
 
360 aa  95.9  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  20.71 
 
 
396 aa  94  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  25.89 
 
 
380 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  23.98 
 
 
418 aa  90.9  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  23.2 
 
 
1061 aa  90.9  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  22.03 
 
 
360 aa  90.5  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  21.32 
 
 
403 aa  90.5  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  22.65 
 
 
1061 aa  89  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  23.08 
 
 
359 aa  86.3  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  22.48 
 
 
358 aa  86.3  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  24.19 
 
 
360 aa  85.9  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  25.59 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  20.99 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  24.84 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  22.78 
 
 
359 aa  84  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  22 
 
 
417 aa  82.8  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  20.88 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  22.07 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0048  permease YjgP/YjgQ  23.69 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  22.87 
 
 
392 aa  79  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  21.58 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  21.58 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  21.58 
 
 
370 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  23.42 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  23.84 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  23.33 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  21.17 
 
 
370 aa  75.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  22.01 
 
 
361 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  22.55 
 
 
387 aa  72  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  22.44 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  23.81 
 
 
356 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  24.23 
 
 
397 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 
362 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  20.54 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  24.76 
 
 
358 aa  70.9  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  23.9 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  21.08 
 
 
370 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  22.74 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  20.55 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  21.14 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  24.4 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  21.67 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  20 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0375  permease YjgP/YjgQ family protein  20.88 
 
 
361 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0887769 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  21.67 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>