229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1417 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 384 aa  770    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  25.79 
 
 		 418 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  27.01 
 
 		 389 aa  123  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  25.13 
 
 		 391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  24.29 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  26.99 
 
 		 792 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  26.13 
 
 		 382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  26.32 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.29 
 
 		 364 aa  105  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 391 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  23.06 
 
 		 401 aa  93.2  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  25.45 
 
 		 391 aa  92.8  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  24.05 
 
 		 365 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  24.01 
 
 		 391 aa  89.7  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  28.86 
 
 		 370 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  24.43 
 
 		 442 aa  89  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  22.72 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  22.33 
 
 		 401 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  24.53 
 
 		 392 aa  87.4  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  25.37 
 
 		 403 aa  86.3  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  27.23 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  24.47 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  26.97 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  23.62 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  26.97 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  21.18 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  22.83 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  27.48 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  23.81 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  24.37 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  26.36 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  24.61 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  23.98 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  22.05 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  19.95 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  23.44 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  23.19 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  28.1 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  23.14 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  21.32 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  22.47 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  20.05 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  21.28 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  22.98 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  22.31 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  22.31 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  21.25 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  24.65 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  22.25 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_002950  PG0598  hypothetical protein  22.27 
 
 		 651 aa  67.8  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  21.57 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  23.63 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  22.56 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  25.3 
 
 		 371 aa  67  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  23.44 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  28.74 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  30.18 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  23.42 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  22.31 
 
 		 358 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  24.72 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  21.32 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  29.31 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  23.05 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  24.11 
 
 		 501 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  20.62 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  20.9 
 
 		 1040 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  23.27 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  22.14 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  24.85 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  20 
 
 		 441 aa  59.7  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  21.39 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  25.79 
 
 		 498 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  28.74 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  28.24 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  22.96 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  28.24 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  28.16 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0972  YjgP/YjgQ permease  24.79 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  27.38 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  30.16 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  21.74 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  26.16 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  17.65 
 
 		 1153 aa  57  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  30.16 
 
 		 388 aa  57  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  37.4 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  21 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3417  permease YjgP/YjgQ family protein  25.47 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2838  permease YjgP/YjgQ family protein  22.32 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  36.64 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  20.84 
 
 		 360 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3065  permease YjgP/YjgQ family protein  25.88 
 
 		 396 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  25.58 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  23.49 
 
 		 370 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  27.98 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1043  hypothetical protein  20.18 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0296445  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  23.58 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  26.83 
 
 		 353 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  30.25 
 
 		 376 aa  54.3  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0048  permease YjgP/YjgQ  24.6 
 
 		 352 aa  53.9  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  22.39 
 
 		 380 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>