233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_09981 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_09981  putative permease  100 
 
 
401 aa  803    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  60.26 
 
 
403 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  59.15 
 
 
395 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  59.04 
 
 
395 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  56.51 
 
 
384 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  52.71 
 
 
401 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  52.97 
 
 
401 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  51.04 
 
 
400 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  50.92 
 
 
386 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  52.03 
 
 
386 aa  355  1e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  37.67 
 
 
394 aa  294  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  39.42 
 
 
392 aa  293  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  39.52 
 
 
391 aa  292  8e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  38.44 
 
 
388 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  37.63 
 
 
395 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  37.82 
 
 
391 aa  269  5.9999999999999995e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  38.83 
 
 
393 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  38.83 
 
 
393 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  37.63 
 
 
395 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  33.6 
 
 
374 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  32.7 
 
 
434 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  31.18 
 
 
389 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  29.71 
 
 
365 aa  179  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  25.47 
 
 
356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  26.72 
 
 
356 aa  126  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  29.27 
 
 
1040 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  27.13 
 
 
389 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  24.35 
 
 
399 aa  106  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  23.73 
 
 
418 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  26.49 
 
 
391 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  25.44 
 
 
391 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  24.52 
 
 
382 aa  95.9  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  25.52 
 
 
391 aa  94.4  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  22.76 
 
 
364 aa  90.5  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  23.14 
 
 
370 aa  90.1  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  23.49 
 
 
361 aa  89.7  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  27.22 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  23.94 
 
 
423 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  22.81 
 
 
362 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  23.8 
 
 
417 aa  85.5  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  23.85 
 
 
418 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  26.2 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  20.9 
 
 
792 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  25.58 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  24.52 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  22.85 
 
 
364 aa  82.8  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 
1153 aa  82.8  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  22.31 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  24.02 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 
384 aa  79.7  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  21.39 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  22.78 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  24.07 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  24.92 
 
 
359 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  21.93 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  22.04 
 
 
480 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  24.15 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 
387 aa  75.5  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  22.19 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  24.09 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  23.55 
 
 
1061 aa  73.2  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  22.61 
 
 
360 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0048  permease YjgP/YjgQ  24.77 
 
 
352 aa  72.4  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  32.61 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  22.58 
 
 
360 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  22.57 
 
 
363 aa  72.8  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  24.01 
 
 
397 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  21.64 
 
 
1111 aa  71.6  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  21.2 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  25.19 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  22.02 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  22.99 
 
 
1061 aa  70.5  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  30.66 
 
 
444 aa  69.7  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  22.81 
 
 
402 aa  69.7  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  22.96 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  22.25 
 
 
359 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  23.26 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  20.85 
 
 
394 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  26.91 
 
 
396 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  23.2 
 
 
495 aa  65.1  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  22.83 
 
 
392 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_002950  PG0598  hypothetical protein  22.76 
 
 
651 aa  64.7  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0684  permease YjgP/YjgQ family protein  23.18 
 
 
346 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000671821  normal  0.0817909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  20.95 
 
 
359 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  23.98 
 
 
379 aa  63.5  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  23.12 
 
 
371 aa  63.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  24.28 
 
 
371 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  24.28 
 
 
383 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  25.93 
 
 
443 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  23.99 
 
 
371 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  21.67 
 
 
478 aa  60.1  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  23.41 
 
 
371 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  22.12 
 
 
360 aa  59.7  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  21.01 
 
 
1096 aa  59.7  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  22.04 
 
 
359 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  24.82 
 
 
442 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  19.03 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  23.51 
 
 
375 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  21.56 
 
 
352 aa  58.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  23.42 
 
 
355 aa  57.8  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>