More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1288 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 356 aa  699    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  33.8 
 
 		 365 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  30.6 
 
 		 392 aa  203  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  32.22 
 
 		 394 aa  196  5.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  31.34 
 
 		 391 aa  195  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  31.32 
 
 		 391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  30.57 
 
 		 1040 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  26.67 
 
 		 388 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  28.73 
 
 		 356 aa  169  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  29.08 
 
 		 395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  28.8 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  25.47 
 
 		 401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  31.58 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  29.69 
 
 		 393 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  29.69 
 
 		 393 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  28.73 
 
 		 434 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  26.01 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  27.15 
 
 		 374 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  29.63 
 
 		 359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  25.74 
 
 		 401 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  29.53 
 
 		 418 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  26.25 
 
 		 400 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  27.81 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  30.96 
 
 		 384 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  28.18 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  27.35 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  26.07 
 
 		 1153 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  25.2 
 
 		 401 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  27.1 
 
 		 359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  28.61 
 
 		 386 aa  139  7e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  28.43 
 
 		 358 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  28.18 
 
 		 391 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  28.89 
 
 		 389 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  28.18 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  27.56 
 
 		 1096 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  25.95 
 
 		 1061 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  25.95 
 
 		 1061 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  26.74 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  28.45 
 
 		 399 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  28.21 
 
 		 359 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  26.57 
 
 		 364 aa  126  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  32.33 
 
 		 418 aa  126  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  25.36 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  26.37 
 
 		 792 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.45 
 
 		 364 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  27.99 
 
 		 360 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  23.66 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  27.67 
 
 		 360 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  24.51 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  26.84 
 
 		 360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  25.98 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  24.79 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  23.96 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  26.39 
 
 		 364 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  28.53 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 360 aa  106  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  27.55 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  27.35 
 
 		 357 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  22.69 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  27.48 
 
 		 359 aa  102  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  23.2 
 
 		 358 aa  102  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  24.18 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  25.95 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 		 1111 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  26.13 
 
 		 360 aa  101  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  27.99 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  22.87 
 
 		 360 aa  98.6  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  23.42 
 
 		 359 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  27.41 
 
 		 364 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  23.27 
 
 		 392 aa  96.7  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  28.95 
 
 		 380 aa  96.7  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  21.22 
 
 		 362 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  23.95 
 
 		 442 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  21.98 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  28.13 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  28.13 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  27.45 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  27.1 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  27.1 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  27.02 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  20.65 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  23.1 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  22.91 
 
 		 354 aa  90.1  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  22.35 
 
 		 356 aa  89.7  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  23.45 
 
 		 356 aa  90.1  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  22.73 
 
 		 355 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  26.3 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  24.85 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  21.57 
 
 		 359 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  26.86 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  19.32 
 
 		 357 aa  87.8  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  25.79 
 
 		 350 aa  87  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0375  permease YjgP/YjgQ family protein  24.57 
 
 		 361 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0887769 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  28.31 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  28.31 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  21.66 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  21.61 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  23.74 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  19.83 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>