217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0318 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 363 aa  737    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  27.5 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  27.67 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  27 
 
 		 418 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  24.29 
 
 		 384 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  24.72 
 
 		 391 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  25.41 
 
 		 391 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  26.51 
 
 		 792 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  24.46 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  25.26 
 
 		 395 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  25.26 
 
 		 395 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  24.3 
 
 		 403 aa  106  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  27.49 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  23.64 
 
 		 391 aa  103  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  21.7 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  23.04 
 
 		 391 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  22.46 
 
 		 364 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  27.59 
 
 		 379 aa  97.8  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  23.44 
 
 		 392 aa  97.1  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  24.1 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  24.54 
 
 		 394 aa  93.2  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  23.27 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  23.54 
 
 		 365 aa  89.4  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  26.09 
 
 		 1040 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  21.56 
 
 		 434 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  23.45 
 
 		 389 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  22.82 
 
 		 401 aa  85.9  9e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  22.63 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  24.43 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  25.94 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  22.86 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  27.37 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  25.4 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  24.87 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  25.77 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  23.99 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  24.87 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  22.89 
 
 		 1096 aa  81.3  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  22.92 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  24.33 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  32.12 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  23.29 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  22.63 
 
 		 1061 aa  80.5  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  21.08 
 
 		 1153 aa  79.3  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  22.35 
 
 		 1061 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  25.07 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  21.89 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  25.07 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  21.11 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  23.51 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  22.54 
 
 		 481 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  22.62 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  25.2 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  21.15 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1043  hypothetical protein  22.22 
 
 		 377 aa  72  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0296445  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  24.1 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  24.87 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  21.45 
 
 		 359 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  22.49 
 
 		 1111 aa  70.1  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  22.56 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  23.28 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  20.05 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  22.4 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  23.78 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  27.32 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  25.45 
 
 		 376 aa  67  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  22.96 
 
 		 360 aa  67  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  23.71 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  25.57 
 
 		 443 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  21.56 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  23.93 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  18.01 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  24.4 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.91 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  21.11 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  19.81 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  22.91 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0684  permease YjgP/YjgQ family protein  30.34 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000671821  normal  0.0817909 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  21.52 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  22.34 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  20.95 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  23.28 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  22.91 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  26.04 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  22.31 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  20.27 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  21.14 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  21.81 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  23.1 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  20.7 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  28.73 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  20.11 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  26.9 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  22.67 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  23.25 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2209  permease YjgP/YjgQ family protein  23.82 
 
 		 377 aa  57  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  18.73 
 
 		 359 aa  57  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  23.04 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  22.32 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>