135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1059 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 498 aa  1024    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  55.65 
 
 		 501 aa  552  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  41.98 
 
 		 483 aa  395  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0011  permease YjgP/YjgQ family protein  32.2 
 
 		 527 aa  305  9.000000000000001e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  35.83 
 
 		 480 aa  292  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  35.39 
 
 		 478 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_002950  PG0598  hypothetical protein  30.02 
 
 		 651 aa  212  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  28.2 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06260  hypothetical protein  28.72 
 
 		 456 aa  177  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0371515  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  26.78 
 
 		 441 aa  173  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  25.54 
 
 		 442 aa  172  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  26.82 
 
 		 442 aa  171  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  26.78 
 
 		 403 aa  171  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  25.91 
 
 		 495 aa  168  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2110  permease YjgP/YjgQ family protein  28.46 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185125  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  25.65 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  24.79 
 
 		 481 aa  147  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  26.05 
 
 		 443 aa  146  9e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  27.96 
 
 		 418 aa  88.6  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  27.47 
 
 		 389 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  27.1 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  24.89 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  25.69 
 
 		 379 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  26.24 
 
 		 358 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  27.72 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  27.37 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  29.63 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  24.67 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3065  permease YjgP/YjgQ family protein  28.26 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  26.72 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  24.29 
 
 		 356 aa  67  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  23.73 
 
 		 394 aa  67  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  24.14 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  23.63 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  28.97 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  19.87 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  23.23 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  23.76 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  25.79 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  31.5 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  24.74 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  29.69 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  31.5 
 
 		 395 aa  57  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  33.09 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  35.71 
 
 		 401 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 		 1096 aa  56.6  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  29.69 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  25.6 
 
 		 364 aa  55.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  30.71 
 
 		 359 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  29.82 
 
 		 364 aa  54.7  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  25.22 
 
 		 339 aa  54.7  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  21.52 
 
 		 376 aa  54.3  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  28.87 
 
 		 792 aa  53.9  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  26.61 
 
 		 402 aa  53.5  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  26.61 
 
 		 402 aa  53.5  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  25.55 
 
 		 372 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  23.01 
 
 		 389 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  20.72 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  25.55 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  29.69 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  23.31 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  20.44 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  30.49 
 
 		 394 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1043  hypothetical protein  28.35 
 
 		 377 aa  52  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0296445  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  23.94 
 
 		 391 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  27.52 
 
 		 366 aa  51.6  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  23.47 
 
 		 374 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  31.87 
 
 		 365 aa  51.6  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  23.93 
 
 		 389 aa  52  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  36.62 
 
 		 378 aa  51.6  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  23.74 
 
 		 402 aa  52  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  30.83 
 
 		 359 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  23.93 
 
 		 389 aa  52  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1296  permease YjgP/YjgQ family protein  26.18 
 
 		 395 aa  50.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00381796  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  36.51 
 
 		 384 aa  50.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  20.54 
 
 		 393 aa  50.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  22.03 
 
 		 388 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  20 
 
 		 371 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  20 
 
 		 371 aa  50.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  25.81 
 
 		 359 aa  50.1  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  30.91 
 
 		 361 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  34.72 
 
 		 386 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  23.72 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  21.5 
 
 		 388 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2209  permease YjgP/YjgQ family protein  28.15 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0366  permease YjgP/YjgQ family protein  23.67 
 
 		 336 aa  50.1  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000710908  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  20 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  25.81 
 
 		 360 aa  48.5  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  29.25 
 
 		 359 aa  48.5  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  25.15 
 
 		 391 aa  48.5  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3066  permease YjgP/YjgQ family protein  32.05 
 
 		 355 aa  48.5  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.326563 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  24.72 
 
 		 363 aa  48.5  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  29.03 
 
 		 386 aa  47.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  24.52 
 
 		 1040 aa  47.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  27 
 
 		 358 aa  47.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  29.82 
 
 		 387 aa  47.8  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  24.43 
 
 		 360 aa  47  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  30 
 
 		 359 aa  47  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>