80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0366 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0366  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 336 aa  650    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000710908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  21.07 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  24.71 
 
 		 495 aa  58.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  28.5 
 
 		 1061 aa  57.4  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  28.19 
 
 		 1061 aa  57  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  31.2 
 
 		 434 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  21.64 
 
 		 389 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  24.18 
 
 		 442 aa  53.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  20.17 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5798  YjgP/YjgQ like transporter  23.21 
 
 		 363 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.159259 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  21.95 
 
 		 443 aa  51.2  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  22.09 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  23.75 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  22.4 
 
 		 390 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  20.17 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2808  permease YjgP/YjgQ  22.18 
 
 		 372 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.94667  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  25.19 
 
 		 1153 aa  50.8  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  24.84 
 
 		 390 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  24.73 
 
 		 373 aa  50.4  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  24.27 
 
 		 442 aa  50.4  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2472  permease YjgP/YjgQ family protein  22.65 
 
 		 364 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1856  permease YjgP/YjgQ  22.65 
 
 		 364 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  23.67 
 
 		 498 aa  50.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2467  permease YjgP/YjgQ family protein  22.65 
 
 		 364 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0748  YjgP/YjgQ permease  24.91 
 
 		 341 aa  50.1  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 480 aa  49.7  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2384  permease YjgP/YjgQ family protein  22.5 
 
 		 363 aa  49.3  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  22.58 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  23.93 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2516  permease YjgP/YjgQ family protein  22.5 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  25.61 
 
 		 481 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  23.31 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2200  YjgP/YjgQ family protein  25.15 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.395164  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1856  permease YjgP/YjgQ family protein  25.15 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  23.5 
 
 		 389 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0598  hypothetical protein  20.98 
 
 		 651 aa  47.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  20.92 
 
 		 392 aa  47.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  22.5 
 
 		 403 aa  47.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0995  permease YjgP/YjgQ  26.74 
 
 		 339 aa  47  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1190  permease YjgP/YjgQ family protein  21.49 
 
 		 380 aa  46.6  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504268  normal  0.434542 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2684  permease YjgP/YjgQ  22.92 
 
 		 373 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0827  permease YjgP/YjgQ family protein  22.54 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  32.61 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  21.2 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  28.06 
 
 		 501 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  23.11 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  23.05 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  23.51 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  23.63 
 
 		 441 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  23.12 
 
 		 388 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  23.08 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  27.33 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  19.28 
 
 		 384 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  23.04 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  24.62 
 
 		 1096 aa  44.3  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  24.65 
 
 		 1111 aa  44.3  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  22.93 
 
 		 388 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  20.11 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  21.08 
 
 		 398 aa  44.3  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  21.71 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  23.02 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  20.11 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  26.77 
 
 		 395 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  22.87 
 
 		 381 aa  43.9  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  26.77 
 
 		 395 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2114  permease YjgP/YjgQ family protein  23.31 
 
 		 386 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.774642 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06260  hypothetical protein  25 
 
 		 456 aa  43.5  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0371515  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  18.91 
 
 		 399 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  20.11 
 
 		 371 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  21.89 
 
 		 388 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  22.46 
 
 		 389 aa  43.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2838  permease YjgP/YjgQ family protein  22.58 
 
 		 405 aa  43.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  28.05 
 
 		 358 aa  42.7  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  22.55 
 
 		 367 aa  43.1  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  22.06 
 
 		 359 aa  42.7  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  23.98 
 
 		 444 aa  42.7  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3639  membrane protein, YjgP/YjgQ like  25 
 
 		 365 aa  42.7  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  26.06 
 
 		 358 aa  42.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  22.46 
 
 		 389 aa  42.4  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  22.46 
 
 		 389 aa  42.4  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>