214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1901 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 441 aa  896    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  61.99 
 
 		 442 aa  579  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  60.13 
 
 		 442 aa  565  1e-160  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  61.49 
 
 		 443 aa  559  1e-158  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  56.01 
 
 		 403 aa  503  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  53.51 
 
 		 441 aa  481  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  54.67 
 
 		 444 aa  478  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  33.33 
 
 		 481 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  28.85 
 
 		 483 aa  203  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  28.88 
 
 		 478 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  28.39 
 
 		 501 aa  177  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  26.25 
 
 		 480 aa  176  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  25.86 
 
 		 498 aa  169  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0011  permease YjgP/YjgQ family protein  24.69 
 
 		 527 aa  167  5e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0598  hypothetical protein  24.68 
 
 		 651 aa  144  4e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  24.22 
 
 		 495 aa  143  5e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  25.64 
 
 		 417 aa  143  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2110  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 486 aa  129  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185125  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  23.02 
 
 		 391 aa  127  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06260  hypothetical protein  24.53 
 
 		 456 aa  126  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0371515  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  24.36 
 
 		 418 aa  111  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  23.02 
 
 		 399 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  22.82 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  26.05 
 
 		 391 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  25.51 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  23.36 
 
 		 391 aa  97.4  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  27.9 
 
 		 389 aa  93.6  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  21.57 
 
 		 792 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  21.29 
 
 		 418 aa  90.1  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  22.57 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  28.69 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  27.88 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  22.63 
 
 		 363 aa  87  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  21.59 
 
 		 364 aa  86.7  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  26.89 
 
 		 394 aa  86.7  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  24.35 
 
 		 1153 aa  86.3  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  22.04 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  29.66 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  22.3 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  25.69 
 
 		 1061 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  25.69 
 
 		 1061 aa  80.5  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  22.9 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  26 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  23.66 
 
 		 1096 aa  77.4  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  22.56 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  21.28 
 
 		 394 aa  76.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  22.43 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  25.2 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  21.05 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  24.39 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  25.85 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  24.44 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  24.44 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  20.18 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  19.87 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  22.92 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  25.23 
 
 		 364 aa  69.7  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  30.63 
 
 		 360 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  21.14 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  25.7 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  23.58 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  24.03 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  25.5 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  24.72 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  20.41 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  21.09 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  27.13 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  27.13 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  22.39 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  24.86 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  22.87 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  32.43 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  24.52 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  24.8 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  23.99 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  24.52 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  23.11 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  22.69 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  32.65 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  22.41 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  23.68 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  22.41 
 
 		 356 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  24.71 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  25.75 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  22.7 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  23.83 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  22.85 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  20.31 
 
 		 1111 aa  60.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  24.37 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  21.98 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  21.98 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  23.3 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  22.28 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  24.75 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  26.48 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  23.26 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  26.52 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  28.46 
 
 		 361 aa  57  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4009  permease YjgP/YjgQ family protein  25.65 
 
 		 353 aa  57  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.604815 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  25.93 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>