78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0598 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0598  hypothetical protein  100 
 
 
651 aa  1342    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  35.06 
 
 
480 aa  278  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  31.98 
 
 
483 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  35.21 
 
 
478 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  31.88 
 
 
501 aa  225  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0011  permease YjgP/YjgQ family protein  28.32 
 
 
527 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  30.02 
 
 
498 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2110  permease YjgP/YjgQ family protein  29.42 
 
 
486 aa  196  8.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185125  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06260  hypothetical protein  27.58 
 
 
456 aa  196  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0371515  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  26.43 
 
 
495 aa  185  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  26.97 
 
 
481 aa  153  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  25.05 
 
 
442 aa  146  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  25.69 
 
 
441 aa  144  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  24.95 
 
 
442 aa  143  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  25.05 
 
 
444 aa  142  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  26.42 
 
 
443 aa  140  8.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  24.2 
 
 
441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  22.51 
 
 
403 aa  113  9e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  27.7 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  28.08 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  27.84 
 
 
1096 aa  70.1  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  26.72 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  22.27 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  22.76 
 
 
401 aa  64.7  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  27.11 
 
 
392 aa  63.5  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  22.78 
 
 
1153 aa  62.8  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  31.96 
 
 
418 aa  61.6  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1043  hypothetical protein  27.69 
 
 
377 aa  60.8  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0296445  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  24.79 
 
 
423 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  24.77 
 
 
382 aa  58.9  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  28.74 
 
 
792 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  23.5 
 
 
418 aa  56.6  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  24.54 
 
 
399 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  25.17 
 
 
376 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  22.62 
 
 
396 aa  53.9  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  29.46 
 
 
401 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  25.41 
 
 
1061 aa  52.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  21.21 
 
 
397 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  32.94 
 
 
417 aa  52.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  25.41 
 
 
1061 aa  53.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  28.46 
 
 
386 aa  53.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  29.82 
 
 
401 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  23.61 
 
 
359 aa  51.6  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  22.93 
 
 
396 aa  51.2  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  27.16 
 
 
380 aa  50.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  25.81 
 
 
359 aa  50.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  28.95 
 
 
400 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  23.61 
 
 
370 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  27.06 
 
 
391 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  24.74 
 
 
364 aa  49.3  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  32.53 
 
 
434 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  28.41 
 
 
365 aa  48.9  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  26.42 
 
 
395 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  32.14 
 
 
356 aa  48.5  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 
379 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  23.13 
 
 
376 aa  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  23.13 
 
 
376 aa  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  20.59 
 
 
364 aa  47.8  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0366  permease YjgP/YjgQ family protein  20.98 
 
 
336 aa  47.4  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000710908  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0838  putative permease, YjgP/YjgQ family protein  31.34 
 
 
355 aa  47.4  0.0008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0265755  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  21 
 
 
394 aa  46.6  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  24.42 
 
 
391 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  30.23 
 
 
391 aa  45.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  34.78 
 
 
358 aa  45.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  36.99 
 
 
389 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  25.47 
 
 
395 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  20.79 
 
 
1040 aa  45.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  29.63 
 
 
364 aa  45.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  33.33 
 
 
360 aa  45.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  26.42 
 
 
361 aa  45.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  21.46 
 
 
402 aa  44.7  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  34.85 
 
 
366 aa  44.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  21.46 
 
 
402 aa  44.7  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  25.37 
 
 
388 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  22.37 
 
 
402 aa  44.3  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  22.18 
 
 
389 aa  43.9  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  21.92 
 
 
363 aa  43.9  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  23.66 
 
 
390 aa  43.9  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.259826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>