253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1462 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 495 aa  1003    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06260  hypothetical protein  46.44 
 
 		 456 aa  382  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0371515  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2110  permease YjgP/YjgQ family protein  43.43 
 
 		 486 aa  343  2.9999999999999997e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185125  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  29.15 
 
 		 480 aa  213  7e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  30.13 
 
 		 478 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  28.95 
 
 		 501 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_002950  PG0598  hypothetical protein  26.43 
 
 		 651 aa  185  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  28.42 
 
 		 483 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0011  permease YjgP/YjgQ family protein  25.95 
 
 		 527 aa  182  2e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  25.91 
 
 		 498 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  24.95 
 
 		 481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  25.43 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  24.95 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  25.48 
 
 		 442 aa  146  6e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  27 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  21.37 
 
 		 441 aa  137  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  25.22 
 
 		 403 aa  133  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  23.14 
 
 		 441 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  24.09 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  27.82 
 
 		 402 aa  83.2  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  21.46 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  26.73 
 
 		 1061 aa  81.3  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  26.73 
 
 		 1061 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  29.17 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  29.17 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  21.24 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  24.19 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  24.8 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  21.88 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  25.55 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  35.56 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  26.67 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  22.57 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  30.3 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  23.05 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  24.6 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  25.55 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  25.13 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  25.11 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  21.14 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  25 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  31.25 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  25.56 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  22.4 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  24.9 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  31.65 
 
 		 792 aa  67  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  20.14 
 
 		 389 aa  67  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  25.84 
 
 		 401 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  21.25 
 
 		 398 aa  66.6  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  24.39 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  22.95 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  22.79 
 
 		 368 aa  65.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  24.39 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  22.69 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  22.69 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  23.2 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  22.95 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  25 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  23.27 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  23.28 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  20.65 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  24.11 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  26.06 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  23.65 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  26.48 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  26.03 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2838  permease YjgP/YjgQ family protein  26.15 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  26.57 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  35.71 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  29.63 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  24.2 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  24.77 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  22.41 
 
 		 367 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  25.79 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  29.84 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  27.91 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  29.46 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  22.79 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  22.76 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  22.65 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  30.33 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  24.63 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  25.33 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  25.18 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  25.44 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3417  permease YjgP/YjgQ family protein  31.15 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1190  permease YjgP/YjgQ family protein  23.63 
 
 		 380 aa  59.7  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504268  normal  0.434542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  27.78 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  21.75 
 
 		 392 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  21.65 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  28.06 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  22.63 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0366  permease YjgP/YjgQ family protein  24.71 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000710908  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  24.74 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  24.4 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  24.74 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  26.79 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  25.65 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>