226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0508 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  100 
 
 
396 aa  800    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  53.3 
 
 
402 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  53.76 
 
 
402 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  53.49 
 
 
402 aa  412  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  41.87 
 
 
390 aa  316  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1757  permease YjgP/YjgQ  42.48 
 
 
416 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00499873  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  38.85 
 
 
399 aa  306  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  37.79 
 
 
393 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  40.64 
 
 
393 aa  289  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  34.64 
 
 
388 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  34.31 
 
 
388 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0556  permease YjgP/YjgQ family protein  31.28 
 
 
386 aa  190  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.023803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  30.51 
 
 
389 aa  186  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  30.03 
 
 
389 aa  186  9e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  30.03 
 
 
389 aa  186  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  31.37 
 
 
388 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  32.68 
 
 
389 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2838  permease YjgP/YjgQ family protein  29.22 
 
 
405 aa  178  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  29.56 
 
 
388 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  31.92 
 
 
389 aa  170  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  29.88 
 
 
388 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  31.6 
 
 
390 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  27.46 
 
 
388 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  28.78 
 
 
388 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  26.44 
 
 
373 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  28.33 
 
 
396 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  23.6 
 
 
379 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  25.54 
 
 
382 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1190  permease YjgP/YjgQ family protein  24.05 
 
 
380 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504268  normal  0.434542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  25.52 
 
 
371 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  24.6 
 
 
376 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  24.19 
 
 
376 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  24.19 
 
 
376 aa  97.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  25.61 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  20.23 
 
 
398 aa  90.1  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  26.47 
 
 
418 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  24.92 
 
 
389 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  23.55 
 
 
399 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  20.78 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 
370 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  23.01 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  21.23 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  25.37 
 
 
370 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  26.02 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  23.92 
 
 
418 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  25.73 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  25.73 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  25.74 
 
 
371 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  22.46 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  21.96 
 
 
423 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  23.94 
 
 
370 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  24.72 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  22.67 
 
 
391 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  27.4 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  23.45 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  22.67 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  23.77 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  23.43 
 
 
371 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  22.89 
 
 
392 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  24.39 
 
 
495 aa  65.5  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  23.83 
 
 
379 aa  64.3  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  21.23 
 
 
370 aa  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  21.75 
 
 
371 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  21.62 
 
 
371 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2596  permease YjgP/YjgQ family protein  27.66 
 
 
364 aa  63.5  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0445451 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  19.78 
 
 
369 aa  63.2  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  21.75 
 
 
371 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  23.53 
 
 
369 aa  62.4  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  23.05 
 
 
384 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  23.08 
 
 
388 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1369  hypothetical protein  23.55 
 
 
370 aa  61.6  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  27 
 
 
442 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3081  permease YjgP/YjgQ  24.18 
 
 
360 aa  60.1  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.770978  normal  0.0713723 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2826  permease YjgP/YjgQ family protein  22.65 
 
 
370 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00420336  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3005  permease YjgP/YjgQ family protein  22.65 
 
 
370 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000818676  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  25.09 
 
 
366 aa  60.1  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  22.03 
 
 
356 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  27.84 
 
 
368 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  25.29 
 
 
443 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 
370 aa  58.9  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  21.14 
 
 
1061 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  22.06 
 
 
356 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  25.93 
 
 
373 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  21.28 
 
 
366 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2908  permease YjgP/YjgQ family protein  22.65 
 
 
370 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000409785  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  22.51 
 
 
372 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  21.14 
 
 
1061 aa  57.4  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  23.1 
 
 
363 aa  57  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  22.66 
 
 
380 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  23.76 
 
 
379 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  20.61 
 
 
366 aa  57  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  22.06 
 
 
372 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  26.39 
 
 
388 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  24.32 
 
 
358 aa  55.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  21.98 
 
 
358 aa  55.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1179  permease YjgP/YjgQ family protein  24.72 
 
 
370 aa  54.7  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301073  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  22.05 
 
 
371 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0049  permease YjgP/YjgQ  24.41 
 
 
367 aa  54.3  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  22.05 
 
 
383 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>