172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3046 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 398 aa  800    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  47.98 
 
 		 386 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  33.33 
 
 		 396 aa  189  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  31.48 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0556  permease YjgP/YjgQ family protein  31.07 
 
 		 386 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  32.46 
 
 		 388 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  32.13 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  30.71 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  28.49 
 
 		 373 aa  149  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  30.17 
 
 		 389 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  33.33 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  33.33 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  30.36 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  30.25 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  31.91 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  31.8 
 
 		 388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  30.07 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  31.45 
 
 		 388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  26.55 
 
 		 376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  28.65 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2838  permease YjgP/YjgQ family protein  30.1 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  25.7 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  26.69 
 
 		 376 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  30.26 
 
 		 390 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  29.37 
 
 		 378 aa  123  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  26.4 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  25.94 
 
 		 391 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1190  permease YjgP/YjgQ family protein  28.02 
 
 		 380 aa  120  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504268  normal  0.434542 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  26.37 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  24.92 
 
 		 371 aa  112  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  28.02 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  24.41 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  25.4 
 
 		 402 aa  103  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  25.77 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  24.06 
 
 		 402 aa  99.8  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  26.33 
 
 		 399 aa  99.4  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  30.07 
 
 		 393 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  30.07 
 
 		 393 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  23.8 
 
 		 402 aa  96.3  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  26.62 
 
 		 391 aa  94.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  23.99 
 
 		 418 aa  93.2  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1757  permease YjgP/YjgQ  27.9 
 
 		 416 aa  90.1  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00499873  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  20.23 
 
 		 396 aa  90.1  6e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  27.04 
 
 		 418 aa  87.4  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  28.57 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  23.78 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  24.2 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  27.69 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  25.5 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  25.96 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  25.85 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  23.24 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  27.36 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  25 
 
 		 443 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  28.92 
 
 		 397 aa  72.8  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3905  permease YjgP/YjgQ family protein  26.71 
 
 		 400 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  23.56 
 
 		 792 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  23.55 
 
 		 363 aa  67  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  26.54 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  21.25 
 
 		 495 aa  66.6  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  21.71 
 
 		 366 aa  66.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  24.03 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  22.67 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  27.31 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  23.73 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  21.73 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2743  permease YjgP/YjgQ family protein  21.61 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.731454  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  21.73 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  24.81 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  21.45 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  23.91 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  21.55 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0496  permease YjgP/YjgQ  23.31 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  23.74 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  20.8 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  22.38 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  25.36 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  23 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  23.48 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  25.47 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  21.94 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  23.26 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  20.8 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0976  putative permease, YjgP/YjgQ family  21.71 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3417  permease YjgP/YjgQ family protein  25.98 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  23.38 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  23.38 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  22.1 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  25.47 
 
 		 375 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  22.79 
 
 		 358 aa  59.7  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  21.95 
 
 		 392 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  22.47 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  22.66 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  24.19 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  25.12 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  23.64 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0099  permease YjgP/YjgQ family protein  27.92 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  26.28 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>