218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0496 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0496  permease YjgP/YjgQ  100 
 
 		 414 aa  824    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  61.29 
 
 		 402 aa  498  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3905  permease YjgP/YjgQ family protein  59.7 
 
 		 400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3065  permease YjgP/YjgQ family protein  29.2 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2421 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3417  permease YjgP/YjgQ family protein  26.92 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  26.7 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1679  permease YjgP/YjgQ family protein  26.58 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.164561  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  24.58 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  24.01 
 
 		 418 aa  97.4  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  25.57 
 
 		 399 aa  87  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  26.39 
 
 		 418 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  25.29 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  25.41 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  25.07 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  24.02 
 
 		 792 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  24.43 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  25.15 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  25.44 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  26.05 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  27.03 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  22.45 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  24.35 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  25.52 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  25.17 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  24.37 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  29.11 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  25.35 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  25.52 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  28.11 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  25.32 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  22.16 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  24.76 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  26.09 
 
 		 372 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  21.53 
 
 		 388 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  22.4 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  23.99 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5426  hypothetical protein  29.96 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.521103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  25.94 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  24.29 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  23.93 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  23.39 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  25.9 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  23.36 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  26.2 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  26.2 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  25.14 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  24.23 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  21.88 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  20.63 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  21.04 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  21.27 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  28.03 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  23.31 
 
 		 398 aa  67  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.57 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  25.3 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  22.4 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  23.8 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  20.57 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  23.67 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  24.61 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  24.12 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  23.96 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  22.7 
 
 		 370 aa  62.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  24.68 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  24.15 
 
 		 370 aa  62.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  22.41 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  21.39 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  24.42 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  24.22 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4864  putative permease  22.6 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000973807  normal  0.308777 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4827  putative permease  22.6 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000984202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  21.98 
 
 		 394 aa  62  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  32.65 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4764  putative permease  22.6 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000634787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4883  permease  22.6 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00332815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  22 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  23.17 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4734  putative permease  22.6 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000385303  normal  0.325053 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  22 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04127  conserved inner membrane protein  22.32 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000245131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4834  putaitve permease  22.32 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000998605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5783  putative permease  22.32 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000294674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4517  putative permease  22.32 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.2463499999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3751  permease YjgP/YjgQ family protein  22.32 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04091  hypothetical protein  22.32 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000267736  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4742  putative permease  22.32 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000002134  normal  0.891327 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  21.36 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  25.6 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  23.32 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3647  permease YjgP/YjgQ family protein  22.06 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000993409  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  21.93 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3556  permease YjgP/YjgQ family protein  22.44 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  19.66 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  24.49 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  24.49 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  21.56 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  24.49 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>