136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1679 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1679  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 409 aa  816    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.164561  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5426  hypothetical protein  62.5 
 
 		 230 aa  217  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.521103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3065  permease YjgP/YjgQ family protein  40.05 
 
 		 396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2421 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3417  permease YjgP/YjgQ family protein  40.17 
 
 		 402 aa  206  6e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  28.97 
 
 		 402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3905  permease YjgP/YjgQ family protein  28.17 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0496  permease YjgP/YjgQ  27.88 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  25.92 
 
 		 399 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  25.27 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 		 389 aa  97.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  24.04 
 
 		 391 aa  93.6  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  25.9 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  25.27 
 
 		 382 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 391 aa  87  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  25.5 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  23.08 
 
 		 1111 aa  75.9  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  29.11 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1234  permease YjgP/YjgQ family protein  24.13 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  24.39 
 
 		 1061 aa  69.7  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  24.12 
 
 		 1061 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  24.43 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  20.96 
 
 		 1096 aa  65.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  22.65 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  23.69 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  26.85 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0622  permease YjgP/YjgQ family protein  23.3 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0271293  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  23.6 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  24.56 
 
 		 792 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  19.89 
 
 		 1153 aa  60.5  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  25.94 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  25.95 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  25 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  24.48 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  25.95 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  23.76 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  22.57 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0053  permease YjgP/YjgQ  23.87 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1014  hypothetical protein  23.81 
 
 		 365 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146018  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  23.03 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  21.82 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0671  permease, putative  23.81 
 
 		 365 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1174  permease, putative  23.81 
 
 		 365 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2340  hypothetical protein  23.81 
 
 		 365 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2945  hypothetical protein  23.81 
 
 		 365 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1021  hypothetical protein  23.81 
 
 		 365 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1654  hypothetical protein  23.81 
 
 		 365 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.398552  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2596  permease YjgP/YjgQ family protein  28.04 
 
 		 364 aa  54.7  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0445451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  21.95 
 
 		 358 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  28.03 
 
 		 371 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  28.03 
 
 		 371 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  21.75 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1856  permease YjgP/YjgQ  22.97 
 
 		 364 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2467  permease YjgP/YjgQ family protein  22.97 
 
 		 364 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  21.69 
 
 		 370 aa  53.9  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  22.49 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2472  permease YjgP/YjgQ family protein  22.97 
 
 		 364 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  23.75 
 
 		 386 aa  53.5  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  27.39 
 
 		 371 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.13 
 
 		 360 aa  53.1  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  28.15 
 
 		 373 aa  53.1  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  22.75 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5798  YjgP/YjgQ like transporter  24.49 
 
 		 363 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.159259 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  25.85 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  22.46 
 
 		 370 aa  52.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  23.4 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0827  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  20.16 
 
 		 360 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  22.57 
 
 		 365 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0822  permease, putative  23.49 
 
 		 365 aa  52.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  19.55 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  22.89 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2200  YjgP/YjgQ family protein  22.75 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.395164  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1856  permease YjgP/YjgQ family protein  22.75 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  23.73 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0684  permease YjgP/YjgQ family protein  24.43 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000671821  normal  0.0817909 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  23.68 
 
 		 370 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  20.87 
 
 		 370 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  20.87 
 
 		 370 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  21.14 
 
 		 370 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  22.51 
 
 		 371 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  25.17 
 
 		 370 aa  50.4  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  25.54 
 
 		 389 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3639  membrane protein, YjgP/YjgQ like  22.26 
 
 		 365 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  24.59 
 
 		 370 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  20.52 
 
 		 370 aa  50.1  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  22.09 
 
 		 363 aa  49.7  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  24.18 
 
 		 372 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2416  hypothetical protein  22.19 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  21.48 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2786  permease YjgP/YjgQ family protein  23.59 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  21.6 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2384  permease YjgP/YjgQ family protein  22.54 
 
 		 363 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2220  permease YjgP/YjgQ family protein  23.03 
 
 		 372 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2808  permease YjgP/YjgQ  21.38 
 
 		 372 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.94667  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2226  permease YjgP/YjgQ family protein  24.04 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>