More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2530 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 378 aa  770    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  37.29 
 
 		 373 aa  260  3e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  36.57 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0556  permease YjgP/YjgQ family protein  30.36 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  30.64 
 
 		 389 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  30.36 
 
 		 389 aa  156  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  30.36 
 
 		 389 aa  156  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  28.57 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  29.97 
 
 		 388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  28.85 
 
 		 388 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  29.37 
 
 		 398 aa  139  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  28.93 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  27.78 
 
 		 376 aa  136  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  27.78 
 
 		 376 aa  136  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  26.54 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  29.97 
 
 		 371 aa  126  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  32.67 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  27.66 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  26.91 
 
 		 388 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  28.21 
 
 		 382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  27.3 
 
 		 388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  26.9 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  25.81 
 
 		 388 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1190  permease YjgP/YjgQ family protein  26.42 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504268  normal  0.434542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  27.58 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  25.27 
 
 		 389 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  27.27 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  25.07 
 
 		 399 aa  105  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  25.87 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2838  permease YjgP/YjgQ family protein  25.41 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1757  permease YjgP/YjgQ  27.09 
 
 		 416 aa  102  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00499873  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  26.69 
 
 		 402 aa  99.8  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  25.17 
 
 		 393 aa  96.3  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  25.17 
 
 		 393 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  24.86 
 
 		 402 aa  92  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  24.86 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  27.47 
 
 		 367 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  24.19 
 
 		 418 aa  87  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  27.01 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  24.04 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  25.18 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  23.3 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  25.43 
 
 		 418 aa  82.8  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2407  permease YjgP/YjgQ  30.3 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.481022  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  26.58 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  25.19 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  22.65 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  25.44 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  24.36 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  23.4 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  25.44 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  23.94 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  26.94 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  23.15 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.79 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.3 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  24.92 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  25.64 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  25.64 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4883  permease  26.09 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00332815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4734  putative permease  26.09 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000385303  normal  0.325053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4764  putative permease  26.09 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000634787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4827  putative permease  26.09 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000984202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4864  putative permease  26.09 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000973807  normal  0.308777 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  23.72 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  25.32 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  26.9 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1943  putative transmembrane protein  29.36 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.729281  normal  0.0884093 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  26.43 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  26.37 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  25.38 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  27.16 
 
 		 386 aa  72.8  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  24.45 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3905  permease YjgP/YjgQ family protein  27.34 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  30.21 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1296  permease YjgP/YjgQ family protein  25.2 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00381796  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  23.01 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  22.67 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2743  permease YjgP/YjgQ family protein  26.27 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.731454  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0976  putative permease, YjgP/YjgQ family  25.79 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  23.05 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2596  permease YjgP/YjgQ family protein  28.28 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0445451 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04127  conserved inner membrane protein  25.42 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000245131  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3751  permease YjgP/YjgQ family protein  25.42 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04091  hypothetical protein  25.42 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000267736  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5783  putative permease  25.42 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000294674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4742  putative permease  25.42 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000002134  normal  0.891327 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4517  putative permease  25.42 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.2463499999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  30.57 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4834  putaitve permease  25.42 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000998605  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  25.72 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3647  permease YjgP/YjgQ family protein  26.69 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000993409  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0563  permease YjgP/YjgQ family protein  27.51 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000298554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  30.57 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  31.87 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  24.23 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.38 
 
 		 360 aa  67  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  25.32 
 
 		 388 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  21.77 
 
 		 478 aa  67  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>