185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1226 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 373 aa  747    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  37.29 
 
 		 378 aa  240  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  33.53 
 
 		 388 aa  209  7e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0556  permease YjgP/YjgQ family protein  33.6 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  35.79 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  35.79 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  35.16 
 
 		 389 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  33.15 
 
 		 388 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  35.06 
 
 		 388 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  32.47 
 
 		 389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  31.43 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  31.4 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  32.26 
 
 		 388 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  34.2 
 
 		 388 aa  162  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  30.43 
 
 		 388 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  29.89 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  28.81 
 
 		 390 aa  155  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  28.49 
 
 		 398 aa  149  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  31.35 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1757  permease YjgP/YjgQ  29.53 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00499873  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  29.31 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2838  permease YjgP/YjgQ family protein  30.92 
 
 		 405 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  29.84 
 
 		 382 aa  136  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  29.79 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  29.79 
 
 		 376 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  27.37 
 
 		 402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  27.37 
 
 		 402 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  26.44 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  27.09 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  29.71 
 
 		 376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  27.09 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  26.42 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  28.57 
 
 		 386 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1190  permease YjgP/YjgQ family protein  28.36 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504268  normal  0.434542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  27.05 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  27.36 
 
 		 371 aa  109  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  26.69 
 
 		 418 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  26.61 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  27.81 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  22.13 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  30 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  29.67 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  29.67 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  24.22 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  23.97 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  28.27 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  25.21 
 
 		 443 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  23.94 
 
 		 391 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  24.74 
 
 		 389 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.99 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  23.44 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2596  permease YjgP/YjgQ family protein  33.33 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0445451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1943  putative transmembrane protein  29 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.729281  normal  0.0884093 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  26.64 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  26.49 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  25.62 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3538  permease YjgP/YjgQ family protein  29.07 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147965 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  24.11 
 
 		 495 aa  64.3  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  24.79 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  24.64 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  25.81 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  22.9 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3081  permease YjgP/YjgQ  24.44 
 
 		 360 aa  59.3  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.770978  normal  0.0713723 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  26.15 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  21.61 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  23.85 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  24.9 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  23.98 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  23.77 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  26.39 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  27.27 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  24.49 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4923  permease YjgP/YjgQ family protein  25.99 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  24.49 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  24.39 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  21.37 
 
 		 441 aa  57  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  21.59 
 
 		 386 aa  57  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0517  permease  24.2 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  22.95 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  25.1 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3163  permease YjgP/YjgQ family protein  27.59 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  21.99 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  27.07 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  20.75 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  23.11 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1724  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 363 aa  55.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2115  permease YjgP/YjgQ  25.74 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  22.18 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  22.92 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1920  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 363 aa  55.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.960962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  22.86 
 
 		 379 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  28.8 
 
 		 388 aa  54.3  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  24.35 
 
 		 372 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1043  hypothetical protein  25.66 
 
 		 377 aa  53.9  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0296445  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0581  hypothetical protein  25.51 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.201151  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  26.94 
 
 		 389 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  21.15 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1234  permease YjgP/YjgQ family protein  27.59 
 
 		 371 aa  53.5  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  23.99 
 
 		 372 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>