225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0684 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0684  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 346 aa  665    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000671821  normal  0.0817909 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2345  permease YjgP/YjgQ family protein  71.68 
 
 		 346 aa  402  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0049  permease YjgP/YjgQ  38.78 
 
 		 367 aa  185  9e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  28.05 
 
 		 1040 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  24.26 
 
 		 388 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  24 
 
 		 365 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  22.04 
 
 		 1111 aa  85.9  8e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  23.41 
 
 		 792 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  22.37 
 
 		 1061 aa  82.8  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  25.53 
 
 		 391 aa  82.8  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  22.37 
 
 		 1061 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  24.44 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  26.15 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  25.35 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  19.89 
 
 		 1096 aa  80.5  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  20.99 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.36 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  24.35 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  23.86 
 
 		 401 aa  75.9  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  22.91 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  25.35 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  20.39 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  24.02 
 
 		 395 aa  72.8  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  24.79 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  20.22 
 
 		 1153 aa  72.8  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  25.35 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  21.58 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  23.88 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  22.31 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  23.08 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  24.07 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  24.18 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  27.7 
 
 		 495 aa  70.1  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  24.18 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  23.08 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0048  permease YjgP/YjgQ  25.64 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  23.7 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  26.34 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  22.1 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  27.11 
 
 		 384 aa  67  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2209  permease YjgP/YjgQ family protein  26.61 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  23.63 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  25.62 
 
 		 444 aa  66.2  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  26.09 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  21.93 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  24.78 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  28.3 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  25.63 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  26.98 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  23.98 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  22.59 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  22.25 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  21.59 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  25.33 
 
 		 360 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  25.43 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  25.66 
 
 		 364 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  32.56 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  23.3 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  24.74 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  23.97 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  23.44 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  27.79 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  21.8 
 
 		 360 aa  59.3  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  27.79 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  29.38 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  23.2 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  22.95 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0685  permease YjgP/YjgQ family protein  28.34 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000242264  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  24.74 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  27.81 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  20.17 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  24.26 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  26.08 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  23.45 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4009  permease YjgP/YjgQ family protein  22.52 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.604815 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  25.34 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  25.64 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  26.93 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 371 aa  57  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  25.97 
 
 		 397 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  23.22 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  23.39 
 
 		 369 aa  55.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  20.79 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  28.26 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  22.76 
 
 		 434 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2344  permease YjgP/YjgQ family protein  29.27 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  21.27 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  25.94 
 
 		 353 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0375  permease YjgP/YjgQ family protein  26.2 
 
 		 361 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0887769 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  21.05 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  23.89 
 
 		 392 aa  53.9  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  26.84 
 
 		 369 aa  53.5  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  21.45 
 
 		 358 aa  53.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  23.12 
 
 		 369 aa  53.5  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  22.1 
 
 		 403 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2114  permease YjgP/YjgQ  26.18 
 
 		 368 aa  53.1  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  22.95 
 
 		 359 aa  53.1  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>