86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2344 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2344  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 338 aa  657    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0685  permease YjgP/YjgQ family protein  65.29 
 
 		 337 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000242264  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0048  permease YjgP/YjgQ  32.76 
 
 		 352 aa  129  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  22.99 
 
 		 1096 aa  82  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  23.19 
 
 		 1061 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  23.19 
 
 		 1061 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  22.13 
 
 		 434 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  22.59 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  20.78 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  21.93 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  21.02 
 
 		 1111 aa  63.9  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  18.66 
 
 		 1153 aa  63.2  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  23.12 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  30.67 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  26.84 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  29.01 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  22.66 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  26.95 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 356 aa  57  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  26.88 
 
 		 389 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  21.64 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  21.29 
 
 		 357 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2743  permease YjgP/YjgQ family protein  21.67 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.731454  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  26.1 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  27.97 
 
 		 370 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  21.94 
 
 		 365 aa  54.3  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  21.82 
 
 		 395 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  22.83 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  21.95 
 
 		 391 aa  53.9  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  22.58 
 
 		 401 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  21.82 
 
 		 395 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  28.64 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  27.22 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  19.37 
 
 		 418 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  21.59 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  29.44 
 
 		 357 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  20.45 
 
 		 399 aa  50.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0684  permease YjgP/YjgQ family protein  29.92 
 
 		 346 aa  50.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000671821  normal  0.0817909 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1183  permease YjgP/YjgQ  37.36 
 
 		 381 aa  49.7  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.807963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  30.67 
 
 		 371 aa  49.3  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  29.15 
 
 		 362 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  29.15 
 
 		 362 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  23.46 
 
 		 373 aa  49.3  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  22.03 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2312  permease YjgP/YjgQ  28.78 
 
 		 362 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  23.66 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  30.88 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  32.97 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  26.14 
 
 		 1040 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  25.32 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  26.54 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  21 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  23.62 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  25.32 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  21.25 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  23.91 
 
 		 364 aa  47  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  30.83 
 
 		 363 aa  46.6  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  23.95 
 
 		 374 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  25.34 
 
 		 372 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  32.87 
 
 		 388 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  27.12 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  26.55 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  25.34 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  30.15 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  25.41 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  20.65 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  24.24 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  24.75 
 
 		 360 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  20.51 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  25.3 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  22.64 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  23.59 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 		 792 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  22.73 
 
 		 388 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  21.2 
 
 		 393 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  21.2 
 
 		 393 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2209  permease YjgP/YjgQ family protein  33.7 
 
 		 377 aa  43.9  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3065  permease YjgP/YjgQ family protein  35.8 
 
 		 396 aa  43.9  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2421 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  24.25 
 
 		 401 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  32.74 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  33.08 
 
 		 423 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0049  permease YjgP/YjgQ  44.68 
 
 		 367 aa  43.5  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1302  permease YjgP/YjgQ  35.82 
 
 		 353 aa  43.5  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  26.73 
 
 		 389 aa  43.1  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  22.1 
 
 		 362 aa  43.1  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3075  permease YjgP/YjgQ  26.63 
 
 		 366 aa  42.7  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>