32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1302 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1302  permease YjgP/YjgQ  100 
 
 		 353 aa  697    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0272  permease YjgP/YjgQ  51.27 
 
 		 353 aa  377  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.720647  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1587  tRNA-I(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  49.15 
 
 		 354 aa  360  2e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1664  methionyl-tRNA formyltransferase  46.76 
 
 		 356 aa  349  5e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0335  hypothetical protein  42.21 
 
 		 352 aa  292  7e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0358  hypothetical protein  41.93 
 
 		 352 aa  290  2e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1652  hypothetical protein  42.21 
 
 		 352 aa  287  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000404268  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1363  hypothetical protein  41.13 
 
 		 353 aa  279  5e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0213  permease YjgP/YjgQ family protein  36.93 
 
 		 353 aa  241  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.763286  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0467  permease YjgP/YjgQ  32.38 
 
 		 359 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  18.14 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  19.31 
 
 		 359 aa  57  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  20.13 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  20.97 
 
 		 364 aa  53.1  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  22.95 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  19.28 
 
 		 360 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  18.41 
 
 		 360 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  18.13 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  22.96 
 
 		 360 aa  47.8  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  23.01 
 
 		 384 aa  47.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  23.24 
 
 		 357 aa  46.2  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0685  permease YjgP/YjgQ family protein  26.95 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000242264  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  20.43 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  20.43 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  19.66 
 
 		 365 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  18.9 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2344  permease YjgP/YjgQ family protein  35.82 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  18 
 
 		 358 aa  43.5  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  19.31 
 
 		 364 aa  43.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  19.88 
 
 		 401 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  22.4 
 
 		 1153 aa  42.7  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  21.14 
 
 		 363 aa  42.7  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>