48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1587 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1587  tRNA-I(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  100 
 
 		 354 aa  702    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1664  methionyl-tRNA formyltransferase  75.42 
 
 		 356 aa  554  1e-157  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0272  permease YjgP/YjgQ  52.54 
 
 		 353 aa  383  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.720647  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1302  permease YjgP/YjgQ  49.15 
 
 		 353 aa  360  2e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0335  hypothetical protein  46.89 
 
 		 352 aa  335  9e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0358  hypothetical protein  46.89 
 
 		 352 aa  333  2e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1652  hypothetical protein  47.18 
 
 		 352 aa  332  4e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000404268  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1363  hypothetical protein  41.16 
 
 		 353 aa  288  7e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0213  permease YjgP/YjgQ family protein  40.52 
 
 		 353 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.763286  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0467  permease YjgP/YjgQ  32.36 
 
 		 359 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  24.03 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  23.89 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  22.95 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  23.33 
 
 		 356 aa  54.7  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  25.7 
 
 		 353 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  23.21 
 
 		 364 aa  53.9  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  23.51 
 
 		 364 aa  54.3  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  24.65 
 
 		 353 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  21.74 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  22.38 
 
 		 357 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  21.98 
 
 		 354 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  22.54 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  24.84 
 
 		 353 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  23.08 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  23.26 
 
 		 362 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  23.43 
 
 		 360 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  23.08 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  23.26 
 
 		 362 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  21.15 
 
 		 357 aa  47  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1746  permease YjgP/YjgQ  21.34 
 
 		 370 aa  46.2  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.108168  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  20.97 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0838  putative permease, YjgP/YjgQ family protein  23.95 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0265755  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  21.26 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  22.65 
 
 		 403 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0685  permease YjgP/YjgQ family protein  25.17 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000242264  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  22.27 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  22.97 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  25.62 
 
 		 374 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  20.77 
 
 		 362 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  22 
 
 		 355 aa  43.1  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  21.86 
 
 		 364 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  24.26 
 
 		 356 aa  43.1  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  23.86 
 
 		 362 aa  42.7  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  26.42 
 
 		 355 aa  43.1  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  19.64 
 
 		 362 aa  42.7  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1813  permease YjgP/YjgQ  22.02 
 
 		 364 aa  42.7  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578456  normal  0.607435 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2916  permease YjgP/YjgQ  22.17 
 
 		 354 aa  42.7  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>