41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1664 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1664  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 356 aa  710    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1587  tRNA-I(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  75.42 
 
 		 354 aa  554  1e-157  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0272  permease YjgP/YjgQ  53.95 
 
 		 353 aa  380  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.720647  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1302  permease YjgP/YjgQ  46.76 
 
 		 353 aa  349  5e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0335  hypothetical protein  48.3 
 
 		 352 aa  333  2e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1652  hypothetical protein  48.3 
 
 		 352 aa  333  3e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000404268  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0358  hypothetical protein  48.3 
 
 		 352 aa  332  6e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1363  hypothetical protein  43.52 
 
 		 353 aa  308  6.999999999999999e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0213  permease YjgP/YjgQ family protein  39.37 
 
 		 353 aa  256  4e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.763286  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0467  permease YjgP/YjgQ  33.53 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  22.89 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  22.34 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1374  SecD export membrane protein  22.35 
 
 		 352 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  22.07 
 
 		 354 aa  54.3  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  23.68 
 
 		 362 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  24.64 
 
 		 353 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  25.61 
 
 		 353 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  25.23 
 
 		 362 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  22.86 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  25.12 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  25.12 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  21.49 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  25.17 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  23.33 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  23.1 
 
 		 355 aa  46.2  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02662  putative permease, YjgP/YjgQ family  20.93 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0685  permease YjgP/YjgQ family protein  25.35 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000242264  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  21 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 352 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  21.37 
 
 		 362 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  23.98 
 
 		 353 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  20.93 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2916  permease YjgP/YjgQ  21.69 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  22.66 
 
 		 360 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1813  permease YjgP/YjgQ  23.11 
 
 		 364 aa  43.1  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578456  normal  0.607435 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  22.12 
 
 		 357 aa  43.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 		 363 aa  42.7  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  20.56 
 
 		 364 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 		 362 aa  42.7  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  22.54 
 
 		 378 aa  42.7  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>