38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0272 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0272  permease YjgP/YjgQ  100 
 
 		 353 aa  694    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.720647  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1587  tRNA-I(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  52.54 
 
 		 354 aa  383  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1664  methionyl-tRNA formyltransferase  53.95 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1302  permease YjgP/YjgQ  51.27 
 
 		 353 aa  377  1e-103  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1652  hypothetical protein  46.74 
 
 		 352 aa  317  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000404268  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0335  hypothetical protein  46.46 
 
 		 352 aa  317  2e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0358  hypothetical protein  46.46 
 
 		 352 aa  315  6e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1363  hypothetical protein  40.56 
 
 		 353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0213  permease YjgP/YjgQ family protein  41.36 
 
 		 353 aa  268  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.763286  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0467  permease YjgP/YjgQ  37.89 
 
 		 359 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  24.46 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  23.45 
 
 		 359 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2199  YjgP/YjgQ family protein  21.36 
 
 		 357 aa  49.7  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1855  permease YjgP/YjgQ family protein  21.36 
 
 		 357 aa  49.7  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  19.72 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  20.14 
 
 		 353 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  20.57 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  22.41 
 
 		 352 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  22.1 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1813  permease YjgP/YjgQ  23.51 
 
 		 364 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578456  normal  0.607435 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0963  permease YjgP/YjgQ family protein  18.91 
 
 		 353 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  21.35 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  22.56 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0390  permease YjgP/YjgQ family protein  22.82 
 
 		 358 aa  46.6  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  20 
 
 		 360 aa  46.2  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  19.81 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  15.49 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  19.19 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  21.38 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  18.48 
 
 		 364 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  19.54 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  23.05 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  21.28 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  22.8 
 
 		 362 aa  44.3  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  21.23 
 
 		 364 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  19.15 
 
 		 357 aa  43.9  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  21.23 
 
 		 364 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3646  permease YjgP/YjgQ family protein  21.11 
 
 		 360 aa  43.5  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000255423  normal  0.498711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>