230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0764 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 360 aa  725    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  64.64 
 
 		 362 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  64.09 
 
 		 362 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  62.71 
 
 		 362 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  55.8 
 
 		 362 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  55.52 
 
 		 362 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  53.59 
 
 		 362 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0507  YjgP/YjgQ permease  47.93 
 
 		 363 aa  355  5.999999999999999e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1758  permease YjgP/YjgQ  50.28 
 
 		 359 aa  344  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111369  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  37.47 
 
 		 365 aa  246  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  36.91 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  36.44 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  39.01 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  38.46 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2312  permease YjgP/YjgQ  35.99 
 
 		 362 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  38.4 
 
 		 362 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  34.88 
 
 		 361 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  35.71 
 
 		 365 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  35.07 
 
 		 362 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  38.5 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  38.5 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  38.5 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  37.95 
 
 		 363 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2222  permease YjgP/YjgQ family protein  35.46 
 
 		 361 aa  212  7e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.225398 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  35.46 
 
 		 362 aa  210  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  37.67 
 
 		 363 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3075  permease YjgP/YjgQ  31.99 
 
 		 366 aa  166  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20702  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  32.42 
 
 		 364 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  32.42 
 
 		 364 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  32.05 
 
 		 364 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2529  permease YjgP/YjgQ family protein  31.15 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  29.51 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0948  permease YjgP/YjgQ  29.7 
 
 		 368 aa  145  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.046524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2627  permease YjgP/YjgQ family protein  32.06 
 
 		 376 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1189  permease YjgP/YjgQ family protein  30.79 
 
 		 365 aa  139  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216183  normal  0.433432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1813  permease YjgP/YjgQ  28.34 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578456  normal  0.607435 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1225  permease YjgP/YjgQ family protein  32.15 
 
 		 365 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0443365  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0901  permease YjgP/YjgQ family protein  29.37 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  23.94 
 
 		 371 aa  103  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  26.7 
 
 		 359 aa  93.2  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  25.75 
 
 		 362 aa  88.6  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  27.05 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  25.15 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  29.08 
 
 		 350 aa  87.8  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  27.36 
 
 		 366 aa  87  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  25.96 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  24.27 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  23.47 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  23.93 
 
 		 1040 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  24.68 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  23.1 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  21.82 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  25.47 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  27.39 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  26.02 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  25.43 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1374  SecD export membrane protein  26.73 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  25.29 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  25.36 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  27.02 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  22.68 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  22.55 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3555  permease YjgP/YjgQ family protein  26.22 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3537  permease YjgP/YjgQ family protein  22.01 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234236 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  26.45 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0390  permease YjgP/YjgQ family protein  24.46 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  27.36 
 
 		 355 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  22.65 
 
 		 356 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  25.21 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  26.69 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  23.23 
 
 		 792 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  25.47 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  26.01 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  26.01 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  26.01 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1678  permease YjgP/YjgQ family protein  27.49 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.936868  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  23.63 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4195  permease YjgP/YjgQ family protein  24.72 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  24.86 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  22.3 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  22.19 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  24.14 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.085708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  26.79 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0446  permease YjgP/YjgQ family protein  24.18 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  24.47 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  23.64 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  24.44 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  21.26 
 
 		 1153 aa  63.9  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  22.53 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  26.93 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4735  inner membrane protein YjgQ  26.27 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0130058  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4865  inner membrane protein YjgQ  26.27 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000705517  normal  0.203916 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0582  hypothetical protein  24.14 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.878195  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  27.86 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4828  inner membrane protein YjgQ  26.27 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  23.05 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4884  hypothetical protein  26.27 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  26.02 
 
 		 353 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4765  inner membrane protein YjgQ  26.27 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000537326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>