229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2529 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2529  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 367 aa  723    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  37.64 
 
 		 363 aa  224  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  34.44 
 
 		 362 aa  212  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2312  permease YjgP/YjgQ  33.79 
 
 		 362 aa  209  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  34.9 
 
 		 362 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3075  permease YjgP/YjgQ  35.26 
 
 		 366 aa  206  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20702  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  34.42 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  34.43 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  35.14 
 
 		 362 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  34.99 
 
 		 362 aa  202  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  34.81 
 
 		 361 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  33.51 
 
 		 365 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  35.04 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  34.58 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2222  permease YjgP/YjgQ family protein  32.22 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.225398 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  35 
 
 		 362 aa  189  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  33.89 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  34.05 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  34.72 
 
 		 362 aa  186  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  34.72 
 
 		 362 aa  186  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  32.14 
 
 		 369 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1225  permease YjgP/YjgQ family protein  36.81 
 
 		 365 aa  179  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0443365  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1813  permease YjgP/YjgQ  33.33 
 
 		 364 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578456  normal  0.607435 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  31.99 
 
 		 364 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  31.99 
 
 		 364 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  31.15 
 
 		 360 aa  172  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0948  permease YjgP/YjgQ  34.63 
 
 		 368 aa  172  9e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.046524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  30.96 
 
 		 362 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1758  permease YjgP/YjgQ  31.96 
 
 		 359 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111369  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  30.87 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  30.05 
 
 		 362 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1189  permease YjgP/YjgQ family protein  34.5 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216183  normal  0.433432 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2627  permease YjgP/YjgQ family protein  32.26 
 
 		 376 aa  155  9e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0507  YjgP/YjgQ permease  29.94 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  29.78 
 
 		 362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  30.09 
 
 		 362 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  27.86 
 
 		 362 aa  140  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0901  permease YjgP/YjgQ family protein  32.63 
 
 		 373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  28.07 
 
 		 364 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  28.07 
 
 		 355 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  27.54 
 
 		 355 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  28.57 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  25.56 
 
 		 359 aa  87.8  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  25.54 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  24.54 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  24.51 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  25.62 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  22.93 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  23.76 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  22.55 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  22.65 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  28.88 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  24.7 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 		 792 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  23.89 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  23.04 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  24.59 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  23.33 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  23.33 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  22.66 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3537  permease YjgP/YjgQ family protein  24.85 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234236 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  25.68 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  23.69 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  26.67 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04128  conserved inner membrane protein  24.39 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00895829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  24.39 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00436584  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5784  putative permease  24.39 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000901519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04092  hypothetical protein  24.39 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4518  putative permease  24.39 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136034  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4835  putative permease  24.39 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000478457  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3750  permease YjgP/YjgQ family protein  24.39 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000963246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4743  putative permease  24.39 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000687106  normal  0.744445 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  22.52 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  23.77 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2199  YjgP/YjgQ family protein  26.98 
 
 		 357 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4818  putative permease  24.39 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339649  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1855  permease YjgP/YjgQ family protein  26.98 
 
 		 357 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  22.78 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  24.52 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3646  permease YjgP/YjgQ family protein  24.13 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000255423  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4828  inner membrane protein YjgQ  23.16 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4765  inner membrane protein YjgQ  23.16 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000537326  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0390  permease YjgP/YjgQ family protein  23.29 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4735  inner membrane protein YjgQ  23.16 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0130058  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4884  hypothetical protein  23.16 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0446  permease YjgP/YjgQ family protein  23.77 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4865  inner membrane protein YjgQ  23.16 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000705517  normal  0.203916 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  22.95 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3555  permease YjgP/YjgQ family protein  23.76 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  25.13 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  24.66 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  24.04 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  25.2 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  24.31 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  23.16 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  24.6 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  26.3 
 
 		 353 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  24.45 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  23.8 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>