More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3080 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  100 
 
 
362 aa  724    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  44.41 
 
 
356 aa  334  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  49.86 
 
 
358 aa  333  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  38.9 
 
 
382 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2417  hypothetical protein  38.9 
 
 
401 aa  277  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3640  membrane protein, YjgP/YjgQ like  38.9 
 
 
382 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2221  permease YjgP/YjgQ family protein  39.35 
 
 
397 aa  276  4e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.481086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2681  permease YjgP/YjgQ family protein  39.35 
 
 
397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  38.86 
 
 
387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  38.85 
 
 
383 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  39.46 
 
 
373 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.085708 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2385  permease YjgP/YjgQ family protein  38.9 
 
 
382 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2517  permease YjgP/YjgQ family protein  38.9 
 
 
382 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5799  YjgP/YjgQ like transporter  38.64 
 
 
382 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0826  permease YjgP/YjgQ family protein  38.9 
 
 
382 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.792817  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2473  permease YjgP/YjgQ family protein  38.64 
 
 
382 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1857  permease YjgP/YjgQ  38.64 
 
 
382 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.693669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2468  permease YjgP/YjgQ family protein  38.64 
 
 
382 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2227  permease YjgP/YjgQ family protein  38.64 
 
 
382 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1013  hypothetical protein  38.28 
 
 
383 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17557  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0821  hypothetical protein  38.02 
 
 
383 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0670  hypothetical protein  38.02 
 
 
383 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144259  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1173  hypothetical protein  38.02 
 
 
383 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.200928  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1655  hypothetical protein  38.02 
 
 
383 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2944  hypothetical protein  38.02 
 
 
383 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2341  hypothetical protein  38.02 
 
 
383 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1020  hypothetical protein  38.02 
 
 
383 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  37.91 
 
 
369 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2114  permease YjgP/YjgQ  38.94 
 
 
368 aa  239  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0621  permease YjgP/YjgQ family protein  38.1 
 
 
384 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185223  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  37.64 
 
 
369 aa  238  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2597  permease YjgP/YjgQ family protein  39.84 
 
 
368 aa  238  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0582  hypothetical protein  39.11 
 
 
356 aa  236  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.878195  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  38.78 
 
 
365 aa  233  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  35.88 
 
 
381 aa  233  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  38.46 
 
 
369 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1235  permease YjgP/YjgQ family protein  36.51 
 
 
386 aa  229  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.104582  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2171  permease YjgP/YjgQ family protein  36.6 
 
 
379 aa  229  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.103114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3537  permease YjgP/YjgQ family protein  39.73 
 
 
369 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0234236 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  32.76 
 
 
353 aa  206  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  34.41 
 
 
369 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0390  permease YjgP/YjgQ family protein  35.1 
 
 
358 aa  205  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  34.66 
 
 
356 aa  203  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  31.01 
 
 
356 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  33.14 
 
 
355 aa  199  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  34.54 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  34.26 
 
 
358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  34.26 
 
 
358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  34.26 
 
 
358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  32.37 
 
 
353 aa  196  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  32.94 
 
 
357 aa  193  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0446  permease YjgP/YjgQ family protein  33.98 
 
 
358 aa  193  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  34.17 
 
 
360 aa  192  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  29.55 
 
 
354 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4884  hypothetical protein  32.5 
 
 
360 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4735  inner membrane protein YjgQ  32.5 
 
 
360 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0130058  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4828  inner membrane protein YjgQ  32.5 
 
 
360 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105801  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3646  permease YjgP/YjgQ family protein  32.3 
 
 
360 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000255423  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4765  inner membrane protein YjgQ  32.5 
 
 
360 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000537326  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4865  inner membrane protein YjgQ  32.5 
 
 
360 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000705517  normal  0.203916 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  33.7 
 
 
355 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4818  putative permease  32.78 
 
 
360 aa  189  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339649  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  30.79 
 
 
356 aa  189  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  32.56 
 
 
356 aa  189  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04128  conserved inner membrane protein  32.78 
 
 
360 aa  189  9e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00895829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  32.78 
 
 
360 aa  189  9e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00436584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4835  putative permease  32.78 
 
 
360 aa  189  9e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000478457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4518  putative permease  32.78 
 
 
360 aa  189  9e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136034  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4743  putative permease  32.78 
 
 
360 aa  189  9e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000687106  normal  0.744445 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3750  permease YjgP/YjgQ family protein  32.78 
 
 
360 aa  189  9e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000963246  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5784  putative permease  32.78 
 
 
360 aa  189  9e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000901519  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04092  hypothetical protein  32.78 
 
 
360 aa  189  9e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3555  permease YjgP/YjgQ family protein  32.87 
 
 
356 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  32.69 
 
 
355 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  30.86 
 
 
356 aa  186  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  31.03 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  31.11 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0926  permease YjgP/YjgQ family protein  31.21 
 
 
352 aa  184  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  31.11 
 
 
352 aa  184  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  31.11 
 
 
352 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  31.11 
 
 
352 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  32.06 
 
 
351 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  31.92 
 
 
352 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  31.92 
 
 
352 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  31.92 
 
 
352 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  32.01 
 
 
354 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0963  permease YjgP/YjgQ family protein  30.36 
 
 
353 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  31.64 
 
 
352 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2138  permease YjgP/YjgQ  31.87 
 
 
353 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  29.89 
 
 
352 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  30.88 
 
 
352 aa  178  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  32.2 
 
 
353 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  32.01 
 
 
376 aa  176  6e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  29.83 
 
 
353 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  29.94 
 
 
353 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  29.94 
 
 
353 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  29.94 
 
 
353 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  30.31 
 
 
353 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  31.94 
 
 
352 aa  170  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  29.18 
 
 
352 aa  170  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>