136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1758 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1758  permease YjgP/YjgQ  100 
 
 		 359 aa  709    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111369  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  53.31 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  53.04 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  52.49 
 
 		 362 aa  360  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  50.28 
 
 		 360 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0507  YjgP/YjgQ permease  48.76 
 
 		 363 aa  331  1e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  47.24 
 
 		 362 aa  319  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  46.13 
 
 		 362 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  45.3 
 
 		 362 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  40.11 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  39.61 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  38.78 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  40.72 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  39.61 
 
 		 362 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  39.61 
 
 		 362 aa  215  9e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  39.61 
 
 		 362 aa  215  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  35.26 
 
 		 361 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  35.26 
 
 		 365 aa  206  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2222  permease YjgP/YjgQ family protein  35.73 
 
 		 361 aa  206  7e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.225398 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  35.26 
 
 		 365 aa  204  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  33.7 
 
 		 362 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  34.44 
 
 		 361 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  33.88 
 
 		 365 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2312  permease YjgP/YjgQ  34.16 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  33.8 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  34.26 
 
 		 363 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3075  permease YjgP/YjgQ  30.66 
 
 		 366 aa  153  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20702  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  31.04 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1813  permease YjgP/YjgQ  32.34 
 
 		 364 aa  149  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578456  normal  0.607435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2529  permease YjgP/YjgQ family protein  31.96 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2627  permease YjgP/YjgQ family protein  31.86 
 
 		 376 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1189  permease YjgP/YjgQ family protein  32.88 
 
 		 365 aa  140  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216183  normal  0.433432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  29.48 
 
 		 364 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  29.75 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  29.75 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1225  permease YjgP/YjgQ family protein  29.32 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0443365  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0948  permease YjgP/YjgQ  29.19 
 
 		 368 aa  112  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.046524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0901  permease YjgP/YjgQ family protein  30.03 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  25.93 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  25.55 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  26.71 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  25.55 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  24.6 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  25.34 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  23.62 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  24.13 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  23.35 
 
 		 359 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  22.41 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  25.34 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  23.84 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  22.11 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  23.93 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4195  permease YjgP/YjgQ family protein  25.16 
 
 		 358 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2114  permease YjgP/YjgQ  23.75 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  26.92 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  26.14 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  23.96 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  24.36 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  24.51 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3537  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234236 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  25.14 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2171  permease YjgP/YjgQ family protein  22.93 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.103114 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  25.73 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  25.3 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  24.47 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  24.32 
 
 		 358 aa  57  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  24.32 
 
 		 358 aa  57  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 		 358 aa  57  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  22.61 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.085708 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  23.96 
 
 		 1040 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  23.88 
 
 		 353 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  23.26 
 
 		 353 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  23.88 
 
 		 353 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  23.78 
 
 		 355 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0446  permease YjgP/YjgQ family protein  22.71 
 
 		 358 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  23.32 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  22.59 
 
 		 360 aa  53.1  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  22.9 
 
 		 353 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  23.78 
 
 		 355 aa  52.8  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  23.54 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  22.7 
 
 		 353 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  23.2 
 
 		 354 aa  52.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0390  permease YjgP/YjgQ family protein  23.21 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  22.97 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3555  permease YjgP/YjgQ family protein  23.61 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  22.19 
 
 		 792 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  22.79 
 
 		 360 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  21.49 
 
 		 359 aa  50.4  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  25.49 
 
 		 359 aa  50.4  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  22.89 
 
 		 383 aa  49.7  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  23.89 
 
 		 354 aa  49.7  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2199  YjgP/YjgQ family protein  24.46 
 
 		 357 aa  49.3  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1855  permease YjgP/YjgQ family protein  24.46 
 
 		 357 aa  49.3  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  22.11 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0027  permease YjgP/YjgQ family protein  21.97 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  22.83 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  21.59 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4884  hypothetical protein  24.04 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>