265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2406 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  100 
 
 		 381 aa  776    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2171  permease YjgP/YjgQ family protein  80.05 
 
 		 379 aa  612  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.103114 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2114  permease YjgP/YjgQ  67.98 
 
 		 368 aa  490  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  63.61 
 
 		 369 aa  476  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  63.52 
 
 		 365 aa  472  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  63.35 
 
 		 369 aa  471  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  62.99 
 
 		 369 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  62.57 
 
 		 369 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3537  permease YjgP/YjgQ family protein  57.77 
 
 		 369 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234236 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  45.18 
 
 		 373 aa  333  4e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.085708 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2597  permease YjgP/YjgQ family protein  43.64 
 
 		 368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  34.29 
 
 		 356 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  37.5 
 
 		 387 aa  252  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  37.3 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2417  hypothetical protein  35.52 
 
 		 401 aa  239  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2221  permease YjgP/YjgQ family protein  34.84 
 
 		 397 aa  238  9e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.481086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2681  permease YjgP/YjgQ family protein  34.84 
 
 		 397 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  36.19 
 
 		 383 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  36.13 
 
 		 382 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3640  membrane protein, YjgP/YjgQ like  35.85 
 
 		 382 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2473  permease YjgP/YjgQ family protein  37.05 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5799  YjgP/YjgQ like transporter  37.05 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1857  permease YjgP/YjgQ  37.05 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.693669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2468  permease YjgP/YjgQ family protein  37.05 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2385  permease YjgP/YjgQ family protein  37.05 
 
 		 382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2517  permease YjgP/YjgQ family protein  37.05 
 
 		 382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  35.41 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0826  permease YjgP/YjgQ family protein  37.15 
 
 		 382 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.792817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2227  permease YjgP/YjgQ family protein  36.39 
 
 		 382 aa  225  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0670  hypothetical protein  35.46 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1013  hypothetical protein  35.46 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1173  hypothetical protein  35.46 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.200928  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1020  hypothetical protein  35.46 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2944  hypothetical protein  35.46 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1655  hypothetical protein  35.46 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2341  hypothetical protein  35.46 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0821  hypothetical protein  34.9 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0582  hypothetical protein  34.29 
 
 		 356 aa  216  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.878195  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1235  permease YjgP/YjgQ family protein  32.56 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.104582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0621  permease YjgP/YjgQ family protein  32.99 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185223  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  30.87 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  28.98 
 
 		 354 aa  176  8e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2138  permease YjgP/YjgQ  30.62 
 
 		 353 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  30.85 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0963  permease YjgP/YjgQ family protein  28.57 
 
 		 353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  27.5 
 
 		 353 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  28.3 
 
 		 353 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  26.27 
 
 		 355 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  24.86 
 
 		 356 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  26.22 
 
 		 352 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  26.54 
 
 		 352 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  26.32 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02662  putative permease, YjgP/YjgQ family  27.95 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  27.47 
 
 		 353 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  27.2 
 
 		 353 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  27.47 
 
 		 353 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  28.81 
 
 		 353 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  29.08 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  26.25 
 
 		 358 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  26.25 
 
 		 358 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  26.25 
 
 		 358 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0926  permease YjgP/YjgQ family protein  25.53 
 
 		 352 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  26.92 
 
 		 353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  28.8 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1374  SecD export membrane protein  26.05 
 
 		 352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3646  permease YjgP/YjgQ family protein  27.3 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000255423  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  24.8 
 
 		 356 aa  139  6e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  26.19 
 
 		 352 aa  139  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  26.8 
 
 		 353 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  28.26 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  28.19 
 
 		 376 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  25.27 
 
 		 352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4765  inner membrane protein YjgQ  25.98 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000537326  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4828  inner membrane protein YjgQ  25.98 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  25.61 
 
 		 352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4884  hypothetical protein  25.98 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4735  inner membrane protein YjgQ  25.98 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0130058  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  27.39 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4865  inner membrane protein YjgQ  25.98 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000705517  normal  0.203916 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  23.66 
 
 		 356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  25.87 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  25.81 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  26.13 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  25.6 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4818  putative permease  26.51 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339649  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  24.61 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  24.03 
 
 		 356 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  25.81 
 
 		 352 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  25.81 
 
 		 352 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  25.81 
 
 		 352 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04128  conserved inner membrane protein  26.51 
 
 		 360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00895829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  26.51 
 
 		 360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00436584  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3750  permease YjgP/YjgQ family protein  26.51 
 
 		 360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000963246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4518  putative permease  26.51 
 
 		 360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136034  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5784  putative permease  26.51 
 
 		 360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000901519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4835  putative permease  26.51 
 
 		 360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000478457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4743  putative permease  26.51 
 
 		 360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000687106  normal  0.744445 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  25.53 
 
 		 356 aa  134  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04092  hypothetical protein  26.51 
 
 		 360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  25.07 
 
 		 358 aa  133  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>