208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0982 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2385  permease YjgP/YjgQ family protein  85.6 
 
 		 382 aa  634    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 382 aa  777    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3640  membrane protein, YjgP/YjgQ like  99.74 
 
 		 382 aa  776    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2227  permease YjgP/YjgQ family protein  93.72 
 
 		 382 aa  689    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2517  permease YjgP/YjgQ family protein  85.6 
 
 		 382 aa  634    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5799  YjgP/YjgQ like transporter  84.82 
 
 		 382 aa  630  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2473  permease YjgP/YjgQ family protein  84.82 
 
 		 382 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2468  permease YjgP/YjgQ family protein  84.82 
 
 		 382 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1857  permease YjgP/YjgQ  84.55 
 
 		 382 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.693669  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0826  permease YjgP/YjgQ family protein  84.29 
 
 		 382 aa  627  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.792817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0821  hypothetical protein  84.33 
 
 		 383 aa  620  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0670  hypothetical protein  83.81 
 
 		 383 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144259  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1173  hypothetical protein  83.81 
 
 		 383 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.200928  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2341  hypothetical protein  83.81 
 
 		 383 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2944  hypothetical protein  83.81 
 
 		 383 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1013  hypothetical protein  84.07 
 
 		 383 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17557  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1020  hypothetical protein  83.81 
 
 		 383 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1655  hypothetical protein  83.81 
 
 		 383 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2417  hypothetical protein  58.94 
 
 		 401 aa  480  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2681  permease YjgP/YjgQ family protein  59.09 
 
 		 397 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2221  permease YjgP/YjgQ family protein  58.84 
 
 		 397 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.481086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  56.28 
 
 		 383 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  55.96 
 
 		 387 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0621  permease YjgP/YjgQ family protein  52.62 
 
 		 384 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185223  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1235  permease YjgP/YjgQ family protein  51.57 
 
 		 386 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.104582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  37.53 
 
 		 356 aa  292  6e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  39.95 
 
 		 358 aa  270  4e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  38.9 
 
 		 362 aa  265  7e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  37.82 
 
 		 373 aa  265  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.085708 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0582  hypothetical protein  40.84 
 
 		 356 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.878195  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  38.74 
 
 		 369 aa  253  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  38.57 
 
 		 365 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3537  permease YjgP/YjgQ family protein  38.38 
 
 		 369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234236 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  36.55 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2171  permease YjgP/YjgQ family protein  36.52 
 
 		 379 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.103114 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  36.55 
 
 		 369 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  38.46 
 
 		 369 aa  236  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  36.13 
 
 		 381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2114  permease YjgP/YjgQ  36.86 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2597  permease YjgP/YjgQ family protein  37.34 
 
 		 368 aa  226  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  30.5 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2138  permease YjgP/YjgQ  29.55 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  30.16 
 
 		 352 aa  177  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  31.1 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  29.03 
 
 		 357 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  29.89 
 
 		 353 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  29.62 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  29.62 
 
 		 352 aa  171  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  29.62 
 
 		 352 aa  170  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  29.62 
 
 		 352 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0926  permease YjgP/YjgQ family protein  29.76 
 
 		 352 aa  169  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  30.43 
 
 		 352 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  29.03 
 
 		 352 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  29.03 
 
 		 352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  29.03 
 
 		 352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  29.03 
 
 		 352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  27.3 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  25.88 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  29.08 
 
 		 352 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  27.49 
 
 		 356 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  28.14 
 
 		 351 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  26.58 
 
 		 353 aa  162  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  26.02 
 
 		 355 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  28.3 
 
 		 354 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  29.08 
 
 		 352 aa  159  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  29.03 
 
 		 352 aa  159  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  25.47 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  28.34 
 
 		 358 aa  156  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  28.34 
 
 		 358 aa  156  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  28.34 
 
 		 358 aa  156  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  29.33 
 
 		 356 aa  155  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4828  inner membrane protein YjgQ  28.42 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4765  inner membrane protein YjgQ  28.42 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000537326  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4735  inner membrane protein YjgQ  28.42 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0130058  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4884  hypothetical protein  28.42 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4865  inner membrane protein YjgQ  28.42 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000705517  normal  0.203916 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  27.95 
 
 		 354 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  28.92 
 
 		 356 aa  152  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  26.91 
 
 		 358 aa  152  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4818  putative permease  27.88 
 
 		 360 aa  152  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339649  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3646  permease YjgP/YjgQ family protein  28.15 
 
 		 360 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000255423  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04092  hypothetical protein  27.88 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04128  conserved inner membrane protein  27.88 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00895829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  27.88 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00436584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4835  putative permease  27.88 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000478457  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3750  permease YjgP/YjgQ family protein  27.88 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000963246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4743  putative permease  27.88 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000687106  normal  0.744445 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4518  putative permease  27.88 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136034  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5784  putative permease  27.88 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000901519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  26.05 
 
 		 360 aa  150  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  28.2 
 
 		 356 aa  150  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  25.54 
 
 		 356 aa  150  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3555  permease YjgP/YjgQ family protein  28.8 
 
 		 356 aa  149  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  25.53 
 
 		 356 aa  149  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0390  permease YjgP/YjgQ family protein  28.42 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1746  permease YjgP/YjgQ  27.84 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.108168  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  24.6 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  26.77 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  24.87 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  26.82 
 
 		 353 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>