233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1944 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  747    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.085708 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2597  permease YjgP/YjgQ family protein  58.62 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  48.02 
 
 		 369 aa  335  5e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  48.02 
 
 		 369 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2114  permease YjgP/YjgQ  50.26 
 
 		 368 aa  326  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  48.81 
 
 		 369 aa  326  4.0000000000000003e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  48.14 
 
 		 365 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  48.04 
 
 		 369 aa  320  3e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3537  permease YjgP/YjgQ family protein  46.97 
 
 		 369 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234236 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2171  permease YjgP/YjgQ family protein  44.47 
 
 		 379 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.103114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  45.18 
 
 		 381 aa  311  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  40.78 
 
 		 387 aa  279  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  40 
 
 		 383 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2417  hypothetical protein  37.53 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2681  permease YjgP/YjgQ family protein  38.24 
 
 		 397 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2221  permease YjgP/YjgQ family protein  37.98 
 
 		 397 aa  256  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.481086 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  37.82 
 
 		 382 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3640  membrane protein, YjgP/YjgQ like  37.56 
 
 		 382 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  39.4 
 
 		 358 aa  245  6.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  33.87 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2385  permease YjgP/YjgQ family protein  40.17 
 
 		 382 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2517  permease YjgP/YjgQ family protein  40.17 
 
 		 382 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5799  YjgP/YjgQ like transporter  40.17 
 
 		 382 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1857  permease YjgP/YjgQ  40.45 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.693669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2468  permease YjgP/YjgQ family protein  39.89 
 
 		 382 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2473  permease YjgP/YjgQ family protein  39.89 
 
 		 382 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0826  permease YjgP/YjgQ family protein  39.89 
 
 		 382 aa  239  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.792817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0621  permease YjgP/YjgQ family protein  37.87 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185223  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1013  hypothetical protein  38.34 
 
 		 383 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0670  hypothetical protein  38.76 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144259  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1173  hypothetical protein  38.76 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.200928  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1655  hypothetical protein  38.76 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2341  hypothetical protein  38.76 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1020  hypothetical protein  38.76 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2944  hypothetical protein  38.76 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  39.83 
 
 		 362 aa  236  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1235  permease YjgP/YjgQ family protein  38.4 
 
 		 386 aa  235  8e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.104582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0821  hypothetical protein  38.48 
 
 		 383 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2227  permease YjgP/YjgQ family protein  37.56 
 
 		 382 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0582  hypothetical protein  36.73 
 
 		 356 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.878195  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  30.68 
 
 		 354 aa  172  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  28.73 
 
 		 356 aa  164  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2138  permease YjgP/YjgQ  31.93 
 
 		 353 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  31.32 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  28 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  27.87 
 
 		 353 aa  150  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  28.57 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  26.7 
 
 		 356 aa  147  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0963  permease YjgP/YjgQ family protein  29.86 
 
 		 353 aa  146  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  29.11 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  29.82 
 
 		 353 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  28.76 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  27.83 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  31.37 
 
 		 353 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  31.37 
 
 		 353 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2916  permease YjgP/YjgQ  30.03 
 
 		 354 aa  139  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  31.37 
 
 		 353 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  29.23 
 
 		 353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  28 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02662  putative permease, YjgP/YjgQ family  30.46 
 
 		 368 aa  137  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  29.1 
 
 		 353 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  29.97 
 
 		 353 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  27.73 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  26.95 
 
 		 352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  25.63 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  26.28 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  28.17 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0100  permease YjgP/YjgQ family protein  28.85 
 
 		 368 aa  130  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  27.03 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  27.03 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  27.03 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  27.03 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  26.92 
 
 		 356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0926  permease YjgP/YjgQ family protein  25.08 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  27.35 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  25.83 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  27.07 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11680  permease YjgP/YjgQ family  29.34 
 
 		 353 aa  127  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623053  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  26.74 
 
 		 352 aa  126  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0116  hypothetical protein  28.2 
 
 		 368 aa  126  6e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0947899  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  26.45 
 
 		 352 aa  126  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1746  permease YjgP/YjgQ  29.33 
 
 		 370 aa  126  7e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.108168  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3555  permease YjgP/YjgQ family protein  27.32 
 
 		 356 aa  126  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  26.45 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  25.68 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0403  permease YjgP/YjgQ  29.14 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0309466  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  24.32 
 
 		 356 aa  124  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  24.59 
 
 		 356 aa  123  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  26.16 
 
 		 352 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  27.3 
 
 		 358 aa  122  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  27.3 
 
 		 358 aa  122  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  27.3 
 
 		 358 aa  122  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  26.83 
 
 		 376 aa  122  8e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  26.94 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  26.16 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44340  permease YjgP/YjgQ family  29.86 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127644  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  23.68 
 
 		 355 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2744  permease YjgP/YjgQ family protein  28.13 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  23.68 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0538  permease YjgP/YjgQ family protein  27.41 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0426669  normal  0.993388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>