219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_44340 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_44340  permease YjgP/YjgQ family  100 
 
 		 356 aa  693    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127644  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3446  YjgP/YjgQ permease  48.6 
 
 		 359 aa  297  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02855  conserved hypothetical protein  47.9 
 
 		 386 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000166888  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0714  permease YjgP/YjgQ family protein  47.9 
 
 		 359 aa  296  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3159  YjgP/YjgQ permease  48.6 
 
 		 359 aa  296  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02804  hypothetical protein  47.9 
 
 		 359 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000115691  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3264  YjgP/YjgQ permease  48.04 
 
 		 359 aa  292  7e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0403  permease YjgP/YjgQ  39.94 
 
 		 354 aa  225  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0309466  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  33.43 
 
 		 354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2744  permease YjgP/YjgQ family protein  33.43 
 
 		 354 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  31.28 
 
 		 356 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  31.36 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  31.36 
 
 		 356 aa  162  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  31.64 
 
 		 356 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  28.61 
 
 		 353 aa  159  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  29.46 
 
 		 353 aa  156  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  30.88 
 
 		 352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  30.59 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  30.31 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  30.31 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  30.31 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  30.31 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  30.59 
 
 		 352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  31.55 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  32.48 
 
 		 360 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  30.25 
 
 		 353 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  30.31 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  30.23 
 
 		 358 aa  149  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  31.11 
 
 		 354 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  30.03 
 
 		 353 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  30.03 
 
 		 352 aa  149  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  30.03 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  30.94 
 
 		 355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  30.25 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  31.27 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1375  permease YjgP/YjgQ family protein  30.68 
 
 		 357 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  29.75 
 
 		 352 aa  145  9e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  29.97 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  30.11 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  29.46 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  25.28 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0582  hypothetical protein  31.18 
 
 		 356 aa  143  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.878195  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  29.75 
 
 		 352 aa  142  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  29.91 
 
 		 357 aa  142  8e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  27.89 
 
 		 358 aa  142  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11680  permease YjgP/YjgQ family  30.23 
 
 		 353 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623053  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  28.9 
 
 		 352 aa  139  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  29.72 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2138  permease YjgP/YjgQ  30.11 
 
 		 353 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  29.75 
 
 		 352 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  27.73 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  31.01 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0100  permease YjgP/YjgQ family protein  29.64 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02662  putative permease, YjgP/YjgQ family  29.97 
 
 		 368 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  27.64 
 
 		 351 aa  133  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0116  hypothetical protein  29.34 
 
 		 368 aa  133  6e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0947899  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  26.35 
 
 		 354 aa  132  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0538  permease YjgP/YjgQ family protein  28.45 
 
 		 368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0426669  normal  0.993388 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0926  permease YjgP/YjgQ family protein  26.91 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0963  permease YjgP/YjgQ family protein  29.22 
 
 		 353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  30.52 
 
 		 373 aa  125  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.085708 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4009  permease YjgP/YjgQ family protein  29.07 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.604815 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  25.42 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  24.86 
 
 		 356 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  30 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1374  SecD export membrane protein  26.94 
 
 		 352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0390  permease YjgP/YjgQ family protein  27.84 
 
 		 358 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  24.16 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  24.16 
 
 		 355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2597  permease YjgP/YjgQ family protein  29.72 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3640  membrane protein, YjgP/YjgQ like  24.93 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1013  hypothetical protein  24.87 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0670  hypothetical protein  24.62 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144259  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1173  hypothetical protein  24.62 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.200928  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2341  hypothetical protein  24.62 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2944  hypothetical protein  24.62 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1020  hypothetical protein  24.62 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1655  hypothetical protein  24.62 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  27.4 
 
 		 356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0821  hypothetical protein  23.97 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2227  permease YjgP/YjgQ family protein  25.59 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  27.33 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0446  permease YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1857  permease YjgP/YjgQ  24.68 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.693669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2468  permease YjgP/YjgQ family protein  24.42 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2473  permease YjgP/YjgQ family protein  24.42 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 371 aa  109  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  26.27 
 
 		 358 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  26.27 
 
 		 358 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  26.27 
 
 		 358 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  26.18 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  26.46 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0826  permease YjgP/YjgQ family protein  24.42 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.792817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2517  permease YjgP/YjgQ family protein  24.42 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2385  permease YjgP/YjgQ family protein  24.42 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5799  YjgP/YjgQ like transporter  24.16 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1746  permease YjgP/YjgQ  25.13 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.108168  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2114  permease YjgP/YjgQ  24.86 
 
 		 368 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2417  hypothetical protein  24.81 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>