283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0564 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 356 aa  721    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  81.01 
 
 		 358 aa  577  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  81.01 
 
 		 358 aa  577  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  81.01 
 
 		 358 aa  577  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4765  inner membrane protein YjgQ  81.74 
 
 		 360 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000537326  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4828  inner membrane protein YjgQ  81.74 
 
 		 360 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3555  permease YjgP/YjgQ family protein  81.18 
 
 		 356 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4865  inner membrane protein YjgQ  81.74 
 
 		 360 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000705517  normal  0.203916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4735  inner membrane protein YjgQ  81.74 
 
 		 360 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0130058  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4884  hypothetical protein  81.74 
 
 		 360 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04128  conserved inner membrane protein  80.9 
 
 		 360 aa  568  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00895829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  80.9 
 
 		 360 aa  568  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00436584  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  80.9 
 
 		 356 aa  568  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5784  putative permease  80.9 
 
 		 360 aa  568  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000901519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4835  putative permease  80.9 
 
 		 360 aa  568  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000478457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4743  putative permease  80.9 
 
 		 360 aa  568  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000687106  normal  0.744445 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04092  hypothetical protein  80.9 
 
 		 360 aa  568  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4518  putative permease  80.9 
 
 		 360 aa  568  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136034  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3750  permease YjgP/YjgQ family protein  80.9 
 
 		 360 aa  568  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000963246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0390  permease YjgP/YjgQ family protein  80.17 
 
 		 358 aa  566  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4818  putative permease  80.62 
 
 		 360 aa  566  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339649  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3646  permease YjgP/YjgQ family protein  79.78 
 
 		 360 aa  560  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000255423  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0446  permease YjgP/YjgQ family protein  78.49 
 
 		 358 aa  538  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  55.06 
 
 		 356 aa  417  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  52.66 
 
 		 356 aa  388  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  52.51 
 
 		 358 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  52.66 
 
 		 356 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  50 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0926  permease YjgP/YjgQ family protein  51.28 
 
 		 352 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  49.44 
 
 		 353 aa  365  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  49.57 
 
 		 351 aa  361  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  48.3 
 
 		 355 aa  360  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  49.29 
 
 		 352 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  49.29 
 
 		 352 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  49.29 
 
 		 352 aa  354  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  49 
 
 		 352 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  49 
 
 		 352 aa  352  4e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  49 
 
 		 352 aa  352  4e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  49 
 
 		 352 aa  352  4e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  48.72 
 
 		 352 aa  352  5e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  49 
 
 		 352 aa  350  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  48.58 
 
 		 352 aa  350  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  48.72 
 
 		 352 aa  346  3e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  46.89 
 
 		 353 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  48.43 
 
 		 352 aa  341  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  46.72 
 
 		 352 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  46.69 
 
 		 352 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  45.29 
 
 		 354 aa  316  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  40.17 
 
 		 355 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  39.03 
 
 		 354 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  39.6 
 
 		 355 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  38.29 
 
 		 353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  34.84 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  35.13 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  39.43 
 
 		 353 aa  250  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  38.07 
 
 		 353 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  37.14 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  38.57 
 
 		 354 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  37.71 
 
 		 353 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  37.43 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11680  permease YjgP/YjgQ family  39.77 
 
 		 353 aa  243  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623053  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0963  permease YjgP/YjgQ family protein  35.71 
 
 		 353 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  37.85 
 
 		 353 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  34.59 
 
 		 360 aa  229  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1374  SecD export membrane protein  32.86 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2916  permease YjgP/YjgQ  33.71 
 
 		 354 aa  206  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  28.94 
 
 		 356 aa  203  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  34.76 
 
 		 362 aa  202  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  31.34 
 
 		 355 aa  202  9e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  31.34 
 
 		 355 aa  199  7.999999999999999e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  32.12 
 
 		 357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2138  permease YjgP/YjgQ  33.33 
 
 		 353 aa  195  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1746  permease YjgP/YjgQ  29.73 
 
 		 370 aa  187  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.108168  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02662  putative permease, YjgP/YjgQ family  31.04 
 
 		 368 aa  186  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  32.01 
 
 		 350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  27.7 
 
 		 387 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  28.41 
 
 		 356 aa  176  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0538  permease YjgP/YjgQ family protein  30.28 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0426669  normal  0.993388 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  28.57 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0582  hypothetical protein  33.55 
 
 		 356 aa  173  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.878195  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4009  permease YjgP/YjgQ family protein  31.27 
 
 		 353 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.604815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  28.61 
 
 		 358 aa  169  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  31.68 
 
 		 376 aa  166  5e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  28.92 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3640  membrane protein, YjgP/YjgQ like  28.92 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2385  permease YjgP/YjgQ family protein  29.22 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2517  permease YjgP/YjgQ family protein  29.22 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1235  permease YjgP/YjgQ family protein  28.95 
 
 		 386 aa  162  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.104582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2473  permease YjgP/YjgQ family protein  29.22 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1857  permease YjgP/YjgQ  29.22 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.693669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2468  permease YjgP/YjgQ family protein  29.22 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0621  permease YjgP/YjgQ family protein  27.49 
 
 		 384 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185223  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5799  YjgP/YjgQ like transporter  28.95 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0826  permease YjgP/YjgQ family protein  28.95 
 
 		 382 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.792817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2221  permease YjgP/YjgQ family protein  25.64 
 
 		 397 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.481086 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2417  hypothetical protein  26.02 
 
 		 401 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2681  permease YjgP/YjgQ family protein  25.64 
 
 		 397 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1375  permease YjgP/YjgQ family protein  28.53 
 
 		 357 aa  157  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0821  hypothetical protein  28.57 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1013  hypothetical protein  28.31 
 
 		 383 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>