176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0507 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0507  YjgP/YjgQ permease  100 
 
 		 363 aa  733    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  60.61 
 
 		 362 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  60.33 
 
 		 362 aa  428  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  60.61 
 
 		 362 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  47.93 
 
 		 360 aa  355  5.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1758  permease YjgP/YjgQ  48.76 
 
 		 359 aa  331  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111369  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  44.13 
 
 		 362 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  43.58 
 
 		 362 aa  319  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  44.9 
 
 		 362 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  35.44 
 
 		 364 aa  223  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  31.4 
 
 		 362 aa  209  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  32.51 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  33.06 
 
 		 365 aa  206  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  32.51 
 
 		 365 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2222  permease YjgP/YjgQ family protein  33.06 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.225398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  31.68 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  33.06 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2312  permease YjgP/YjgQ  32.51 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  32.79 
 
 		 361 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  30.87 
 
 		 362 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  32.4 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  32.12 
 
 		 362 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  32.12 
 
 		 362 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  30.45 
 
 		 362 aa  182  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  32.51 
 
 		 363 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  31.56 
 
 		 363 aa  175  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  30.7 
 
 		 369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  28.3 
 
 		 364 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  28.3 
 
 		 364 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  27.47 
 
 		 364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2529  permease YjgP/YjgQ family protein  29.94 
 
 		 367 aa  136  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3075  permease YjgP/YjgQ  27.71 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20702  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1189  permease YjgP/YjgQ family protein  27.37 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216183  normal  0.433432 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0948  permease YjgP/YjgQ  28.57 
 
 		 368 aa  133  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.046524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1813  permease YjgP/YjgQ  25 
 
 		 364 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578456  normal  0.607435 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2627  permease YjgP/YjgQ family protein  29.01 
 
 		 376 aa  126  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1225  permease YjgP/YjgQ family protein  29.89 
 
 		 365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0443365  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0901  permease YjgP/YjgQ family protein  27.73 
 
 		 373 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  26.82 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  22.74 
 
 		 364 aa  92.8  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  25.07 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  25.75 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  23.68 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  22.22 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  20.69 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  23.22 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  23.22 
 
 		 352 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  22.04 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  21.57 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  24.84 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  23.1 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  22.91 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 360 aa  67  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  22.91 
 
 		 352 aa  67  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  21.61 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  22.6 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  22.59 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  23.4 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  22.53 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  22.53 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  21.74 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  22.53 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  23.1 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  25.26 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  24.69 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  22.05 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  27.13 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  23.14 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  23.65 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  21.45 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  23.42 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4195  permease YjgP/YjgQ family protein  21.76 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0714  permease YjgP/YjgQ family protein  22.18 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  21.89 
 
 		 354 aa  62  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02804  hypothetical protein  22.18 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000115691  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  22.51 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02855  conserved hypothetical protein  22.18 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000166888  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  21.02 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  22.26 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0926  permease YjgP/YjgQ family protein  21.36 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  22.35 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3446  YjgP/YjgQ permease  22.18 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  22.56 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  22.51 
 
 		 1040 aa  60.1  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  21.65 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3159  YjgP/YjgQ permease  21.83 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  22.22 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  22.72 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  22.28 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  23.37 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0446  permease YjgP/YjgQ family protein  22.13 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  21.24 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  22.59 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  23.37 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  24.14 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3264  YjgP/YjgQ permease  21.86 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  23.82 
 
 		 391 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  21.15 
 
 		 360 aa  57  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  25.13 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  23.32 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>