199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0686 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  733    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  99.72 
 
 		 362 aa  731    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  91.16 
 
 		 362 aa  656    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0507  YjgP/YjgQ permease  60.61 
 
 		 363 aa  448  1e-125  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  55.8 
 
 		 360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1758  permease YjgP/YjgQ  53.31 
 
 		 359 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111369  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  49.16 
 
 		 362 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  48.32 
 
 		 362 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  49.16 
 
 		 362 aa  351  8.999999999999999e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  39.23 
 
 		 362 aa  259  7e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  38.4 
 
 		 362 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  39.89 
 
 		 364 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  41.99 
 
 		 362 aa  250  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  41.99 
 
 		 362 aa  250  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  41.71 
 
 		 362 aa  249  7e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  38.52 
 
 		 365 aa  246  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  38.15 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  37.7 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  35.97 
 
 		 361 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2312  permease YjgP/YjgQ  35.34 
 
 		 362 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2222  permease YjgP/YjgQ family protein  37.02 
 
 		 361 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.225398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  36.16 
 
 		 361 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  40.06 
 
 		 363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  35.62 
 
 		 362 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  34.81 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  36.09 
 
 		 363 aa  213  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  31.4 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  30.87 
 
 		 364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  30.87 
 
 		 364 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3075  permease YjgP/YjgQ  31.13 
 
 		 366 aa  165  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20702  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  31.34 
 
 		 369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1813  permease YjgP/YjgQ  29.64 
 
 		 364 aa  163  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578456  normal  0.607435 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2627  permease YjgP/YjgQ family protein  32.16 
 
 		 376 aa  159  9e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1189  permease YjgP/YjgQ family protein  30.6 
 
 		 365 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216183  normal  0.433432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2529  permease YjgP/YjgQ family protein  30.09 
 
 		 367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1225  permease YjgP/YjgQ family protein  31.71 
 
 		 365 aa  126  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0443365  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0948  permease YjgP/YjgQ  26.92 
 
 		 368 aa  126  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.046524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0901  permease YjgP/YjgQ family protein  30.29 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  26.95 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  24.8 
 
 		 362 aa  91.3  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  25.36 
 
 		 359 aa  90.9  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  25.14 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  23.72 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  25.14 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  25.14 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  25.99 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  23.14 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  22.84 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  24.17 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  22.86 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  25.71 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  24.58 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  22.31 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  23.28 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  27.03 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  21.91 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  23.41 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  22.19 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  20.25 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  24.92 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  20.25 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  22.97 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  25.15 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4195  permease YjgP/YjgQ family protein  23.66 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  22.84 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  21.75 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  18.89 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 		 360 aa  67  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  22.03 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  23.3 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  21.04 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  23.58 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  21.67 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  23.3 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  23.25 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2744  permease YjgP/YjgQ family protein  24.22 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  23.08 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44340  permease YjgP/YjgQ family  26.57 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127644  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  24.18 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  21.43 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  23.24 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11680  permease YjgP/YjgQ family  25.82 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623053  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02662  putative permease, YjgP/YjgQ family  23.66 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  23.91 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  22.67 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0714  permease YjgP/YjgQ family protein  23.16 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  22.85 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3446  YjgP/YjgQ permease  23.16 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02804  hypothetical protein  23.16 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000115691  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02855  conserved hypothetical protein  23.16 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000166888  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  26.61 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  22.67 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  21.88 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  21.31 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  22.81 
 
 		 1040 aa  59.7  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>