153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1211 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 362 aa  722    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  97.24 
 
 		 362 aa  710    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  64.64 
 
 		 360 aa  481  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  64.92 
 
 		 362 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  49.44 
 
 		 362 aa  353  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  48.88 
 
 		 362 aa  348  9e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  49.16 
 
 		 362 aa  348  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0507  YjgP/YjgQ permease  44.13 
 
 		 363 aa  323  2e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1758  permease YjgP/YjgQ  46.13 
 
 		 359 aa  317  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111369  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  35.05 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  34.24 
 
 		 365 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  32.69 
 
 		 361 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  31.87 
 
 		 362 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  33.88 
 
 		 365 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2312  permease YjgP/YjgQ  32.6 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  35.96 
 
 		 364 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  32.14 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  35.26 
 
 		 362 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  36.36 
 
 		 362 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  36.36 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  36.36 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  35.81 
 
 		 363 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2222  permease YjgP/YjgQ family protein  34.64 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.225398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  35.22 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  33.88 
 
 		 362 aa  193  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  34.99 
 
 		 363 aa  183  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3075  permease YjgP/YjgQ  31.99 
 
 		 366 aa  153  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20702  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  28.57 
 
 		 369 aa  152  8.999999999999999e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  28.37 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  28.37 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  28.37 
 
 		 364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2529  permease YjgP/YjgQ family protein  30.87 
 
 		 367 aa  146  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1813  permease YjgP/YjgQ  29.86 
 
 		 364 aa  142  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578456  normal  0.607435 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1225  permease YjgP/YjgQ family protein  29.22 
 
 		 365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0443365  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1189  permease YjgP/YjgQ family protein  27.99 
 
 		 365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216183  normal  0.433432 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2627  permease YjgP/YjgQ family protein  30.96 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0948  permease YjgP/YjgQ  27.3 
 
 		 368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.046524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0901  permease YjgP/YjgQ family protein  28.49 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 		 371 aa  92  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  26.02 
 
 		 364 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  25.07 
 
 		 358 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  24.73 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  25.85 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  25.28 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  22.36 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  23.36 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  23.83 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  26.73 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  24.13 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  24.17 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  20.95 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  21.69 
 
 		 369 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  25.14 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  23.66 
 
 		 1040 aa  64.3  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0390  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 		 358 aa  62  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  25.2 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  23.3 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3555  permease YjgP/YjgQ family protein  26.46 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  22.13 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  22.87 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  24.59 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  24.66 
 
 		 360 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  28.03 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  22.99 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  22.08 
 
 		 356 aa  57  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3537  permease YjgP/YjgQ family protein  21.89 
 
 		 369 aa  57  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234236 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  24.12 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  22.11 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  27.02 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  23.63 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  23.3 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02662  putative permease, YjgP/YjgQ family  23.46 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  21.72 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  25.62 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  23.87 
 
 		 356 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  22.92 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  23.18 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4195  permease YjgP/YjgQ family protein  22.13 
 
 		 358 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  24.87 
 
 		 358 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  21.53 
 
 		 1111 aa  54.3  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4818  putative permease  25.75 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339649  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  24.87 
 
 		 358 aa  54.3  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1678  permease YjgP/YjgQ family protein  26.85 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.936868  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  24.87 
 
 		 358 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  26.67 
 
 		 355 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3646  permease YjgP/YjgQ family protein  25.48 
 
 		 360 aa  53.9  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000255423  normal  0.498711 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04128  conserved inner membrane protein  25.75 
 
 		 360 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00895829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  25.75 
 
 		 360 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00436584  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04092  hypothetical protein  25.75 
 
 		 360 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5784  putative permease  25.75 
 
 		 360 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000901519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4518  putative permease  25.75 
 
 		 360 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136034  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4835  putative permease  25.75 
 
 		 360 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000478457  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3750  permease YjgP/YjgQ family protein  25.75 
 
 		 360 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000963246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4743  putative permease  25.75 
 
 		 360 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000687106  normal  0.744445 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  25.34 
 
 		 355 aa  53.1  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  25.33 
 
 		 353 aa  53.1  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0582  hypothetical protein  23.43 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.878195  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  22.68 
 
 		 356 aa  52.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  23.59 
 
 		 360 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4765  inner membrane protein YjgQ  25.55 
 
 		 360 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000537326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>