More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0409 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 360 aa  725    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  55.31 
 
 		 358 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  53.48 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  51.82 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  46.37 
 
 		 360 aa  355  7.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  43.61 
 
 		 387 aa  322  4e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  45.43 
 
 		 359 aa  311  2e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  29.21 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  25.83 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  26.94 
 
 		 360 aa  145  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  26.37 
 
 		 358 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  24.3 
 
 		 360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  26.74 
 
 		 358 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  26.5 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  27.96 
 
 		 362 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  22.38 
 
 		 362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  24.12 
 
 		 360 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  23.88 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  23.81 
 
 		 359 aa  113  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  22.59 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  25.07 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  21.33 
 
 		 359 aa  106  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 356 aa  106  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  25.56 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  23.39 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  21.81 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  24.4 
 
 		 391 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  25.93 
 
 		 395 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  22.4 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  25.39 
 
 		 395 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  20.86 
 
 		 367 aa  99.8  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  24.51 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0027  permease YjgP/YjgQ family protein  21.82 
 
 		 357 aa  97.8  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  24.65 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 371 aa  96.3  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  26.84 
 
 		 1040 aa  94  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  26.88 
 
 		 389 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  22.95 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  23.5 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  23.4 
 
 		 418 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  22.29 
 
 		 792 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  23.26 
 
 		 392 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  24.6 
 
 		 384 aa  89.4  9e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  23.24 
 
 		 391 aa  88.6  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  24.25 
 
 		 357 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  25.55 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  25.55 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  24.07 
 
 		 401 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  23.68 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  24.25 
 
 		 357 aa  86.7  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  22.67 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  23.58 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  22.93 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  24.47 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  23.12 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  24.51 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  25.41 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  23.12 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  24.46 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  22.7 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  24.02 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  21.84 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  22.55 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  23.24 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  21.29 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  21.52 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  23.58 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  22.96 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  19.33 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  22.19 
 
 		 1061 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  26.03 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  26.03 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  22.59 
 
 		 1061 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2744  permease YjgP/YjgQ family protein  23.29 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  23.51 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  22.84 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 		 1153 aa  72  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  22.43 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  22.55 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3446  YjgP/YjgQ permease  23.86 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  20.29 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  19.1 
 
 		 1111 aa  68.9  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  21.53 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.085708 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  31.25 
 
 		 495 aa  67.8  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2171  permease YjgP/YjgQ family protein  20.06 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.103114 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  22.41 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  25.48 
 
 		 364 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0375  permease YjgP/YjgQ family protein  24.01 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0887769 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02855  conserved hypothetical protein  23.86 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000166888  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  22.42 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1403  permease YjgP/YjgQ family protein  21.14 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0714  permease YjgP/YjgQ family protein  23.86 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02804  hypothetical protein  23.86 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000115691  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  24.48 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  21.58 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2114  permease YjgP/YjgQ  22.49 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>