26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0213 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0213  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 353 aa  710    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.763286  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0272  permease YjgP/YjgQ  41.36 
 
 		 353 aa  287  1e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.720647  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1587  tRNA-I(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  40.52 
 
 		 354 aa  276  4e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1664  methionyl-tRNA formyltransferase  39.37 
 
 		 356 aa  273  3e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1302  permease YjgP/YjgQ  36.93 
 
 		 353 aa  262  8e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1363  hypothetical protein  38.42 
 
 		 353 aa  258  8e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0335  hypothetical protein  38.35 
 
 		 352 aa  256  3e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0358  hypothetical protein  38.35 
 
 		 352 aa  256  4e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1652  hypothetical protein  38.07 
 
 		 352 aa  251  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000404268  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0467  permease YjgP/YjgQ  32.95 
 
 		 359 aa  209  6e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  21.78 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  21.49 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  19.63 
 
 		 364 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1374  SecD export membrane protein  20.97 
 
 		 352 aa  50.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  20.29 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  22.58 
 
 		 360 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  17.76 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  22.64 
 
 		 360 aa  46.2  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  21.1 
 
 		 1153 aa  45.4  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  20.28 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2743  permease YjgP/YjgQ family protein  21.47 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.731454  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  27.97 
 
 		 403 aa  43.9  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  21.05 
 
 		 364 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  29.46 
 
 		 393 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  21.05 
 
 		 364 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  20.99 
 
 		 362 aa  42.7  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>