102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0685 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0685  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 337 aa  653    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000242264  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2344  permease YjgP/YjgQ family protein  65.29 
 
 		 338 aa  417  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0048  permease YjgP/YjgQ  34.6 
 
 		 352 aa  136  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  24.42 
 
 		 1096 aa  90.9  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  22.51 
 
 		 1153 aa  80.5  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  22.48 
 
 		 1061 aa  73.6  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  22.48 
 
 		 1061 aa  73.2  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  23.64 
 
 		 388 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  19.56 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  23.27 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  23.48 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  20.94 
 
 		 365 aa  67  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  24.11 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  21.73 
 
 		 1111 aa  65.1  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  21.71 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  27.78 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  23.23 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  26.29 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  23.21 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  20.65 
 
 		 392 aa  59.3  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  22.83 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 		 792 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  25.69 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  22.83 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  24.29 
 
 		 1040 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  22.93 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  24.81 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  21.94 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  23.68 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  21.16 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  19.6 
 
 		 364 aa  57  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  30.95 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  23.1 
 
 		 401 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  24.9 
 
 		 393 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  21.65 
 
 		 391 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.4 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  22.74 
 
 		 393 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  22.74 
 
 		 393 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  21.28 
 
 		 359 aa  53.1  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  26.16 
 
 		 358 aa  53.1  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2743  permease YjgP/YjgQ family protein  26.4 
 
 		 367 aa  53.1  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.731454  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  31.01 
 
 		 366 aa  53.1  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  29.84 
 
 		 366 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  27.91 
 
 		 481 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  24.91 
 
 		 396 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  25.59 
 
 		 357 aa  50.4  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  24.19 
 
 		 374 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  27.73 
 
 		 389 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  27.88 
 
 		 388 aa  50.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  24.15 
 
 		 364 aa  49.7  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  27.2 
 
 		 363 aa  50.1  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0684  permease YjgP/YjgQ family protein  41.24 
 
 		 346 aa  49.3  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000671821  normal  0.0817909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  33.63 
 
 		 394 aa  49.3  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  19.94 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1043  hypothetical protein  29.59 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0296445  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  23.55 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  25.16 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  25.97 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  24.86 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  29.75 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1183  permease YjgP/YjgQ  26.17 
 
 		 381 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.807963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1587  tRNA-I(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  26.46 
 
 		 354 aa  47  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1664  methionyl-tRNA formyltransferase  26.06 
 
 		 356 aa  47  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  29.66 
 
 		 370 aa  47  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  22.11 
 
 		 358 aa  46.6  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  27.72 
 
 		 418 aa  46.6  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  23.7 
 
 		 366 aa  46.2  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  31.58 
 
 		 378 aa  46.2  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  28.51 
 
 		 371 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  28.51 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  28.51 
 
 		 383 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  20.51 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1302  permease YjgP/YjgQ  26.95 
 
 		 353 aa  45.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  28.07 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  24.71 
 
 		 384 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  25.87 
 
 		 389 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  23.08 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  21.23 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  18.31 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0027  permease YjgP/YjgQ family protein  21.35 
 
 		 357 aa  44.7  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  26.55 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  29.07 
 
 		 373 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  32.11 
 
 		 373 aa  43.9  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  27.92 
 
 		 369 aa  43.5  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  22.65 
 
 		 390 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3160  YjgP/YjgQ permease  29.53 
 
 		 356 aa  43.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  25.37 
 
 		 389 aa  43.1  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  23.58 
 
 		 360 aa  43.1  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  21.43 
 
 		 403 aa  43.1  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  25.37 
 
 		 389 aa  43.1  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  24.55 
 
 		 399 aa  43.1  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  22.03 
 
 		 386 aa  42.7  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  20.97 
 
 		 441 aa  42.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  27.38 
 
 		 402 aa  42.7  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3265  YjgP/YjgQ permease  29.53 
 
 		 356 aa  42.7  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.342085  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02856  conserved hypothetical protein  29.53 
 
 		 356 aa  42.7  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000121999  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  18.5 
 
 		 395 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3447  YjgP/YjgQ permease  29.53 
 
 		 356 aa  42.7  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0713  permease YjgP/YjgQ family protein  29.53 
 
 		 356 aa  42.7  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>