96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6917 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 359 aa  728    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  40.61 
 
 		 367 aa  276  6e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  36.84 
 
 		 360 aa  270  2e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  36.24 
 
 		 360 aa  249  7e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  35.73 
 
 		 358 aa  233  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  35.91 
 
 		 359 aa  231  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0027  permease YjgP/YjgQ family protein  36.29 
 
 		 357 aa  210  3e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  33.15 
 
 		 362 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  33.15 
 
 		 359 aa  189  7e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  32.77 
 
 		 358 aa  170  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  28.69 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  25.49 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  27.02 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  25.34 
 
 		 360 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  23.31 
 
 		 387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  21.82 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  21.81 
 
 		 360 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  23.55 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  21.57 
 
 		 356 aa  87.8  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 792 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  20.26 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  24.09 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  22.55 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  22.07 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  22.56 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  23.73 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.06 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  21.66 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  18.59 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  23.87 
 
 		 391 aa  67  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  18.59 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  20.63 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  24.3 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  20.7 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  21.05 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  19.79 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  20.95 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2199  YjgP/YjgQ family protein  20.69 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1855  permease YjgP/YjgQ family protein  20.69 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  22.58 
 
 		 1096 aa  62.4  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  21.28 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  21.37 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  22.19 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  20.83 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  20.11 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  23.03 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  22.42 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  21.11 
 
 		 374 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  18.96 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  20.72 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  30.71 
 
 		 495 aa  54.3  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  22.28 
 
 		 364 aa  54.7  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0324  permease YjgP/YjgQ family protein  21.96 
 
 		 373 aa  53.5  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  19.27 
 
 		 371 aa  53.1  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  20.81 
 
 		 441 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  21.28 
 
 		 1111 aa  51.6  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  21.21 
 
 		 358 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1746  permease YjgP/YjgQ  18.9 
 
 		 370 aa  51.2  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.108168  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  18.78 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  19.89 
 
 		 394 aa  50.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  19.89 
 
 		 359 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  20.38 
 
 		 356 aa  50.1  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  21.07 
 
 		 369 aa  49.7  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  22.7 
 
 		 382 aa  49.7  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  19.62 
 
 		 400 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  20.64 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  21.61 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  22.16 
 
 		 403 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  20.88 
 
 		 359 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  21.34 
 
 		 363 aa  46.2  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  21.91 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  19.44 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  25.2 
 
 		 480 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  22.07 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2344  permease YjgP/YjgQ family protein  22.04 
 
 		 338 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  22.4 
 
 		 357 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  22.43 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  22.07 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  27.13 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  23.08 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  20.94 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  20.83 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02662  putative permease, YjgP/YjgQ family  20.55 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2209  permease YjgP/YjgQ family protein  20.83 
 
 		 377 aa  44.3  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  20.82 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3417  permease YjgP/YjgQ family protein  24.77 
 
 		 402 aa  44.3  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  21.34 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  22.19 
 
 		 1153 aa  44.3  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  23.58 
 
 		 371 aa  43.5  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  22.55 
 
 		 371 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  22.55 
 
 		 371 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  22.55 
 
 		 371 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0496  permease YjgP/YjgQ  26.67 
 
 		 414 aa  43.1  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  20.36 
 
 		 386 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2138  permease YjgP/YjgQ  19.17 
 
 		 353 aa  42.7  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>