208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0437 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  900    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  61.49 
 
 		 441 aa  527  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  55.76 
 
 		 442 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  53.36 
 
 		 442 aa  499  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  50.79 
 
 		 403 aa  449  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  48.83 
 
 		 444 aa  431  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  49.53 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  33.26 
 
 		 481 aa  222  9e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  26.75 
 
 		 483 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  26.97 
 
 		 480 aa  169  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  27.13 
 
 		 478 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  24.95 
 
 		 495 aa  148  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  26.05 
 
 		 498 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  25.91 
 
 		 501 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_002950  PG0598  hypothetical protein  26.42 
 
 		 651 aa  140  6e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06260  hypothetical protein  26.67 
 
 		 456 aa  136  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0371515  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0011  permease YjgP/YjgQ family protein  24.29 
 
 		 527 aa  136  7.000000000000001e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  23.46 
 
 		 417 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  23 
 
 		 418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  32.46 
 
 		 391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2110  permease YjgP/YjgQ family protein  25.16 
 
 		 486 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  30.6 
 
 		 418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  28.03 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  27.43 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  30.12 
 
 		 391 aa  103  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  23.06 
 
 		 423 aa  97.4  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  20.41 
 
 		 388 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  27.03 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  26.3 
 
 		 365 aa  90.1  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  21.78 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  23.02 
 
 		 1153 aa  89  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  26.77 
 
 		 391 aa  89  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  23.41 
 
 		 792 aa  86.3  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  24.18 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  27.81 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  26.41 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  23.13 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  24.19 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  27.98 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  25.6 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  26.79 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  28.27 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  28.64 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  21.74 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  26.4 
 
 		 392 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  28.88 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  26.47 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  27.85 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  28.29 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 1061 aa  73.6  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 398 aa  72.8  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 		 373 aa  72.8  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  24.48 
 
 		 1061 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  28.43 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  28.43 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  23.89 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  25.12 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  22.42 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  24 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  25.62 
 
 		 364 aa  69.3  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  20.32 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  23.67 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  28.78 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  23.67 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  25.73 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  30.14 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  22.56 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  23.53 
 
 		 389 aa  67  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  22.35 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  26.92 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  21.88 
 
 		 1096 aa  65.9  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  24.69 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  24.58 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  24.69 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  23.42 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  29.05 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  24.62 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  25.54 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  22.97 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  22.97 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  24.62 
 
 		 393 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4009  permease YjgP/YjgQ family protein  28.5 
 
 		 353 aa  62.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.604815 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  23.66 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  24.9 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  23.46 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  23.21 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  25.3 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  19.89 
 
 		 1111 aa  61.6  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  25.32 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  27.78 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  23.79 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  25.93 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  28.28 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  28.28 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  23.31 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  21.51 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  24.79 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  25.29 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  21.07 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  27.56 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>